Genomics：鲨鱼基因组学分析发现关键抑癌基因
来源：本站原创 2020-12-02 23:27
很多报道称鲨鱼中癌症的发病率很低，但没有足够的数据来明确地确认。然而，发表在《Genomics》杂志上的一项研究提供了强有力的证据，证明了短鳍鲨（Isurus oxyrinchus）的基因组中具有抗肿瘤活性。
2020年10月2日讯/生物谷BIOON/---很多报道称鲨鱼中癌症的发病率很低，但没有足够的数据来明确地确认。然而，发表在《Genomics》杂志上的一项研究提供了强有力的证据，证明了短鳍鲨（Isurus oxyrinchus）的基因组中具有抗肿瘤活性。
这种大型浮游鱼类可长达4米，栖息于全球的温带和热带海洋中。它被世界自然保护联盟（IUCN）列为濒危物种。
葡萄牙海洋与大气研究所（IPMA）的渔业观察员从其中一艘船上的四个鲨鱼身上收集了各种器官的组织样本。巴西研究人员对眼睛和肝脏组织样本进行了基因测序，发现该动物肝脏中十个最过量表达的基因中有九个与人类肿瘤抑制有关。
该分析揭示了两个器官中3,774个差异表达的基因-眼睛中1,612个，肝脏中2,162个。眼睛中过度表达的大多数基因与器官的结构和视觉信号传递到大脑有关。几乎没有发现与光有关的基因，这表明该物种可能具有单色视力，并且只能看到相同颜色的阴影，就像科学界已知的所有其他鲨鱼一样。
最近完成的大白鲨（Carcharodon carcharias）的基因组测序是所有鲨鱼物种中最大的测序，揭示了两个具有抗肿瘤活性的正向选择基因。因此，巴西研究人员惊讶地发现，基因组的前十个过表达基因中，与癌症相关的基因不少于九个。
在肝脏中具有高于正常活性的基因中，已知HABP2可以减少甲状腺肿瘤中的集落形成和细胞迁移，而PON3编码的酶可以充当细胞抗氧化剂，保护细胞免受氧化应激，这是一个重要因素在癌症中。
NIT2，RMC1和FGFRK1在各种组织中表达，是潜在的肿瘤抑制因子。前两个涉及结肠癌细胞的抑制，而第三个对前列腺癌的起始和进展中的细胞增殖具有负面影响。
ITIH3与炎症性疾病，精神分裂症，抑郁症，心脏病和胃癌有关。 CBS和A1CF参与结肠癌，卵巢癌和乳腺癌的进展，尽管CBS在神经胶质瘤（一种常见的脑癌）中具有肿瘤抑制作用。 SERPIND1在鲨鱼的伤口快速愈合以及人类的炎症，血液凝固和癌症转移中起作用。
“要确定鲨鱼肝中的相关因子是否可以作用于人类细胞，我们需要从器官中提取提取物，并在肿瘤细胞上对其进行测试。如果发现这种生物活性化合物具有显著的益处，其他研究者们可以合成它们并可能将它们用于生产用于治疗的新药。”（生物谷 Bioon.com）
资讯出处：Genomic analysis of mako shark reveals genes relating to tumor suppression in humans
原始出处：Rodrigo R. Domingues et al, Comparative eye and liver differentially expressed genes reveal monochromatic vision and cancer resistance in the shortfin mako shark (Isurus oxyrinchus), Genomics (2020). DOI: 10.1016/j.ygeno.2020.08.037
这种大型浮游鱼类可长达4米，栖息于全球的温带和热带海洋中。它被世界自然保护联盟（IUCN）列为濒危物种。
葡萄牙海洋与大气研究所（IPMA）的渔业观察员从其中一艘船上的四个鲨鱼身上收集了各种器官的组织样本。巴西研究人员对眼睛和肝脏组织样本进行了基因测序，发现该动物肝脏中十个最过量表达的基因中有九个与人类肿瘤抑制有关。
（图片来源：Www.pixabay.com）
该分析揭示了两个器官中3,774个差异表达的基因-眼睛中1,612个，肝脏中2,162个。眼睛中过度表达的大多数基因与器官的结构和视觉信号传递到大脑有关。几乎没有发现与光有关的基因，这表明该物种可能具有单色视力，并且只能看到相同颜色的阴影，就像科学界已知的所有其他鲨鱼一样。
最近完成的大白鲨（Carcharodon carcharias）的基因组测序是所有鲨鱼物种中最大的测序，揭示了两个具有抗肿瘤活性的正向选择基因。因此，巴西研究人员惊讶地发现，基因组的前十个过表达基因中，与癌症相关的基因不少于九个。
在肝脏中具有高于正常活性的基因中，已知HABP2可以减少甲状腺肿瘤中的集落形成和细胞迁移，而PON3编码的酶可以充当细胞抗氧化剂，保护细胞免受氧化应激，这是一个重要因素在癌症中。
NIT2，RMC1和FGFRK1在各种组织中表达，是潜在的肿瘤抑制因子。前两个涉及结肠癌细胞的抑制，而第三个对前列腺癌的起始和进展中的细胞增殖具有负面影响。
ITIH3与炎症性疾病，精神分裂症，抑郁症，心脏病和胃癌有关。 CBS和A1CF参与结肠癌，卵巢癌和乳腺癌的进展，尽管CBS在神经胶质瘤（一种常见的脑癌）中具有肿瘤抑制作用。 SERPIND1在鲨鱼的伤口快速愈合以及人类的炎症，血液凝固和癌症转移中起作用。
“要确定鲨鱼肝中的相关因子是否可以作用于人类细胞，我们需要从器官中提取提取物，并在肿瘤细胞上对其进行测试。如果发现这种生物活性化合物具有显著的益处，其他研究者们可以合成它们并可能将它们用于生产用于治疗的新药。”（生物谷 Bioon.com）
资讯出处：Genomic analysis of mako shark reveals genes relating to tumor suppression in humans
原始出处：Rodrigo R. Domingues et al, Comparative eye and liver differentially expressed genes reveal monochromatic vision and cancer resistance in the shortfin mako shark (Isurus oxyrinchus), Genomics (2020). DOI: 10.1016/j.ygeno.2020.08.037
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