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Science子刊:在人体中发现新的CD4+T细胞亚群

  1. CD4
  2. sc-eQTL
  3. T细胞
  4. 自身免疫性疾病
  5. 表达数量性状基因座

来源:本站原创 2022-03-07 16:00

T细胞协助对抗感染和癌症方面发挥着重要作用,不过也可导致自身免疫性疾病。如今,在一项新的研究中,来自美国拉霍亚免疫学研究所(LJI)的研究人员在CD4+辅助性T细胞亚群中发现了与自身免疫性疾病风险有关的新基因。

2022年3月7日讯/生物谷BIOON/---T细胞协助对抗感染和癌症方面发挥着重要作用,不过也可导致自身免疫性疾病。如今,在一项新的研究中,来自美国拉霍亚免疫学研究所(LJI)的研究人员在CD4+辅助性T细胞亚群中发现了与自身免疫性疾病风险有关的新基因。相关研究结果近期发表在Science Immunology期刊上,论文标题为“Single-cell eQTL analysis of activated T cell subsets reveals activation and cell type–dependent effects of disease-risk variants”。

在努力阐明这些CD4+ T细胞亚群的确切功能时,这些作者发现了它们的供者之间的的重大遗传学差异,以及这些细胞在男性和女性中可能发挥的功能。

为了推动对人类免疫的进一步研究,他们已为世界各地想要实时研究这些数据集的其他免疫学家创建了一个免费的在线资源,以便下载和使用他们提供的数据。这种数据共享是LJI主持的免疫细胞基因表达、表达数量性状基因座(eQTL)与表观基因组学数据库(DICE)的一部分。

论文通讯作者、LJI教授Pandurangan Vijayanand博士说,“这项研究扩大了我们的DICE资源,有助于科学家们找到与人类疾病风险有关的靶基因和细胞类型。”论文共同第一作者、LJI讲师Benjamin Schmiedel博士说,“这些细胞对于保护身体至关重要,我们发现了许多与人类疾病风险有关的新基因。”

这项新研究让科学界对CD4+T细胞亚群之间的基因表达差异有了迄今为止最深入和最完整的了解。这些作者使用一种称为单细胞RNA测序的方法,比较了来自89名健康献血者的100多万个CD4+T细胞的基因表达差异。

鉴于T细胞在体内可以发挥许多作用,比如“记住”过去的入侵者并提醒其他免疫细胞,因此这些作者预计会发现CD4+T细胞亚群之间的强烈差异。事实上,他们的出发点是希望获得有关他们于2018年发表在Cell期刊上的一项研究(Cell, 2018, doi:10.1016/j.cell.2018.10.022)中探究的8种事先确定的CD4+T细胞亚群的新见解。


T细胞,图片来自CC0 Public Domain。

在以前的研究中,科学家们已研究了从血液样本中分离出来的各种T细胞亚群,而没有刺激它们。在这项新研究中,这些作者在测序和分析之前激活了这些T细胞。这一步骤使得他们能够模拟这些细胞在被要求履行其职责和保护身体免受感染时的反应。Schmiedel.说,“刺激这些T细胞就像打开灯一样---突然间你可以更好地理解这些细胞的功能。”

这项研究揭示了已知的CD4+T细胞细胞亚群,并揭示了其他的、鲜为人知的CD4+T细胞细胞亚群。Schmiedel问道,“为什么这些细胞会有不同的特征?现有文献中没有任何信息可以帮助我们了解这些细胞是什么,所以这是我们想要跟进的事情。”

目前,这些作者已经通过进行单细胞eQTL(sc-eQTL)分析对这些T细胞有了更多了解。这项技术向他们展示了哪些基因受到遗传学的影响,并对不同的T细胞亚型有最深刻的影响。

这些作者还发现了这些T细胞在工作方式方面存在主要的性别差异。在比较出生时被指定为男性或女性的人的T细胞时,他们现多种CD4+T细胞亚群如何与其他免疫细胞沟通,以及它们如何产生抗病的细胞因子。生物学上的性别被证明是这些细胞如何发挥作用的一个重要因素。

这些差异可能有助于解释为什么男性更容易患传染性疾病,如COVID-19,以及为什么女性更容易患自身免疫性疾病。

Schmiedel说,“如果我们能够了解女性的免疫细胞与男性的免疫细胞有什么不同,我们就可以弄清楚为什么某些疾病更容易影响某一性别。”(生物谷 Bioon.com)

参考资料:

1.Benjamin Schmiedel et al. Single-cell eQTL analysis of activated T cell subsets reveals activation and cell-type-dependent effects of disease-risk variants. Science Immunology, 2022, doi:10.1126/sciimmunol.abm2508.

2.LJI team uncovers new subsets of CD4+ ‘helper’ T cells
https://www.lji.org/news-events/news/post/lji-team-uncovers-new-subsets-of-cd4-helper-t-cells/

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