CANCER CELL:探索程序性细胞死亡2 Like (PDCD2L)在结直肠癌中的致癌作用
来源:本站原创 2022-03-02 09:31
近来 Huabin Gao教授及其团队探讨了Programmed Cell Death 2 Like (PDCD2L) 在多种癌症中的表达和预后价值,以阐明 PDCD2L 在人类癌症中的作用。
2022年2月28号讯/生物谷BIOON 癌症发病率在全球范围内迅速增长,癌症在 2020 年导致近 1000 万人死亡。与肿瘤相关的死亡率排名前 3 位的是肺癌(18%)、结直肠癌(9.4%)和肝癌(8.3%)。因此,鉴于癌症的发病率和死亡率,迫切需要寻找完美的生物标志物来诊断和预测各种癌症的预后。
近来 Huabin Gao教授及其团队探讨了Programmed Cell Death 2 Like (PDCD2L) 在多种癌症中的表达和预后价值,以阐明 PDCD2L 在人类癌症中的作用。
本研究PDCD2L在泛癌组织及相应癌旁组织中的表达数据从ONCOMINE网站和TIMER2.0网站下载。PDCD2L在癌症不同临床阶段的表达数据来源于GEPIA2.0网站。不同分子亚型肿瘤中的表达数据来源于TISDB网站。从 GEPIA2 下载总生存数据和无病生存数据。PDCD2L的中位表达分为PDCD2L高表达组和PDCD2L低表达组。采用Log-rank检验分析PDCD2L表达与不同肿瘤患者生存率的关系。通过GEPIA2分析了泛癌中与PDCD2L具有相似表达模式的基因,并选择前100个基因作为候选基因,进行了PDCD2L、18 个 PDCD2L 结合蛋白和 100 个候选基因(包括常见基因 LSM14A)的 GO 富集分析和 KEGG 通路分析。
该实验分析PDCD2L表达及多种癌症免疫浸润关系,探讨PDCD2L表达与多种癌症的癌相关成纤维细胞(CAF)的相关性。此外,通过 TISDB 网站分析了 PDCD2L 表达与不同肿瘤免疫亚型之间的关联,分析PDCD2L表达与不同肿瘤功能状态之间的相关性。实验还进行了细胞系和siRNA转染、RNA提取和定量RT-PCR、免疫组织化学染色和评估、细胞凋亡测定及增殖试验,统计分析相关结果。
PDCD2L 在泛癌中的异常表达
该实验发现 CRC 样本中 PDCD2L 的表达明显高于相应的非肿瘤组织,这表明 PDCD2L 可以作为 CRC 的生物标志物。PDCD2L 可能通过参与凋亡诱导的 CRC 细胞增殖在 CRC 进展中发挥重要作用,该发现为新的治疗技术提供了理论依据。
原始出处:Huabin Gao, Cheng Xu, et al.Pan-cancer analysis of oncogenic role of Programmed Cell Death 2 Like (PDCD2L) and validation in colorectal cancer.Cancer Cell Int. 2022 Feb 25;22(1):100. doi: 10.1186/s12935-022-02525-x.
近来 Huabin Gao教授及其团队探讨了Programmed Cell Death 2 Like (PDCD2L) 在多种癌症中的表达和预后价值,以阐明 PDCD2L 在人类癌症中的作用。
本研究PDCD2L在泛癌组织及相应癌旁组织中的表达数据从ONCOMINE网站和TIMER2.0网站下载。PDCD2L在癌症不同临床阶段的表达数据来源于GEPIA2.0网站。不同分子亚型肿瘤中的表达数据来源于TISDB网站。从 GEPIA2 下载总生存数据和无病生存数据。PDCD2L的中位表达分为PDCD2L高表达组和PDCD2L低表达组。采用Log-rank检验分析PDCD2L表达与不同肿瘤患者生存率的关系。通过GEPIA2分析了泛癌中与PDCD2L具有相似表达模式的基因,并选择前100个基因作为候选基因,进行了PDCD2L、18 个 PDCD2L 结合蛋白和 100 个候选基因(包括常见基因 LSM14A)的 GO 富集分析和 KEGG 通路分析。
该实验分析PDCD2L表达及多种癌症免疫浸润关系,探讨PDCD2L表达与多种癌症的癌相关成纤维细胞(CAF)的相关性。此外,通过 TISDB 网站分析了 PDCD2L 表达与不同肿瘤免疫亚型之间的关联,分析PDCD2L表达与不同肿瘤功能状态之间的相关性。实验还进行了细胞系和siRNA转染、RNA提取和定量RT-PCR、免疫组织化学染色和评估、细胞凋亡测定及增殖试验,统计分析相关结果。
PDCD2L 在泛癌中的异常表达
该实验发现 CRC 样本中 PDCD2L 的表达明显高于相应的非肿瘤组织,这表明 PDCD2L 可以作为 CRC 的生物标志物。PDCD2L 可能通过参与凋亡诱导的 CRC 细胞增殖在 CRC 进展中发挥重要作用,该发现为新的治疗技术提供了理论依据。
原始出处:Huabin Gao, Cheng Xu, et al.Pan-cancer analysis of oncogenic role of Programmed Cell Death 2 Like (PDCD2L) and validation in colorectal cancer.Cancer Cell Int. 2022 Feb 25;22(1):100. doi: 10.1186/s12935-022-02525-x.
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