Genome Biol: 非编码基因组在玉米早期生殖发育过程中的作用
来源:本站原创 2020-07-09 22:57
所有生物的生长和发育都取决于时间和空间上基因表达的协调调节,而这在很大程度上受基因组中非编码序列的控制。
2020年7月10日讯/生物谷BIOON/---所有生物的生长和发育都取决于时间和空间上基因表达的协调调节,而这在很大程度上受基因组中非编码序列的控制。
基因组学促进作物改良的主要挑战是对作物基因组中顺式调控元件的功能性注释,以及通过育种或生物技术利用这些序列来微调目标途径的能力。
近日,由Andrea Eveland博士等研究人员发现,在玉米的早期发育窗口中,非编码的“功能性”基因组图对花粉的形成至关重要。
在这项研究中,研究者们整合了有关染色质结构,转录本谱图和全基因组关联研究的信息,他们的分析提供了对主要谷物作物花序分化调控的全面了解。
相关结果发表在最近的《Genome biology》杂志上。
在过去的一个世纪中,基于杂种的玉米育种和改良导致人们选择较小的穗,这会拦截较少的光,使用较少的资源,并且产量更高。
然而,由于穗与玉米是通过共同的发育程序发育的,因此,进一步改善玉米的性状将需要将该程序解耦联。了解相同基因如何在穗与玉米中受到不同的调控,并利用这种特异性来控制一个彼此之间的差异,将增强玉米的育种工作。
Eveland的研究集中于控制谷物作物植物结构特征的发育机制。具体来说,她研究了干细胞如何形成植物器官,以及潜在的基因调控网络中的变异如何精确调控植物的形态。她的团队整合了计算和实验方法,以探索对这些基因网络的扰动如何改变物种内部的形态,并最终确定修改的靶点。(生物谷 Bioon.com)
资讯出处:Researchers map non-coding, 'functional' genome in maize during early reproductive development
原始出处:Parvathaneni, R. K., et al. (2020) The regulatory landscape of early maize inflorescence development. Genome Biology. doi.org/10.1186/s13059-020-02070-8.
基因组学促进作物改良的主要挑战是对作物基因组中顺式调控元件的功能性注释,以及通过育种或生物技术利用这些序列来微调目标途径的能力。
(图片来源:Www.pixabay.com)
近日,由Andrea Eveland博士等研究人员发现,在玉米的早期发育窗口中,非编码的“功能性”基因组图对花粉的形成至关重要。
在这项研究中,研究者们整合了有关染色质结构,转录本谱图和全基因组关联研究的信息,他们的分析提供了对主要谷物作物花序分化调控的全面了解。
相关结果发表在最近的《Genome biology》杂志上。
在过去的一个世纪中,基于杂种的玉米育种和改良导致人们选择较小的穗,这会拦截较少的光,使用较少的资源,并且产量更高。
然而,由于穗与玉米是通过共同的发育程序发育的,因此,进一步改善玉米的性状将需要将该程序解耦联。了解相同基因如何在穗与玉米中受到不同的调控,并利用这种特异性来控制一个彼此之间的差异,将增强玉米的育种工作。
Eveland的研究集中于控制谷物作物植物结构特征的发育机制。具体来说,她研究了干细胞如何形成植物器官,以及潜在的基因调控网络中的变异如何精确调控植物的形态。她的团队整合了计算和实验方法,以探索对这些基因网络的扰动如何改变物种内部的形态,并最终确定修改的靶点。(生物谷 Bioon.com)
资讯出处:Researchers map non-coding, 'functional' genome in maize during early reproductive development
原始出处:Parvathaneni, R. K., et al. (2020) The regulatory landscape of early maize inflorescence development. Genome Biology. doi.org/10.1186/s13059-020-02070-8.
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