Narure子刊：人类胎盘在健康和疾病中的RNA景观
来源：生物谷 2021-05-24 09:54
2021年5月20日讯/生物谷BIOON/---剑桥大学在Nature communication杂志上发表了题为"The RNA landscape of the human placenta in health and disease"的文章。人类胎盘在健康和疾病中的RNA景观。在这里，作者报告了高质量的RNA-Seq数据，并提供了对人类胎盘转录组的全面
2021年5月20日讯/生物谷BIOON/---剑桥大学在Nature communication杂志上发表了题为"The RNA landscape of the human placenta in health and disease"的文章。人类胎盘在健康和疾病中的RNA景观。在这里，作者报告了高质量的RNA-Seq数据，并提供了对人类胎盘转录组的全面分析。
图片来源：https：//doi.org/10.1038/s41467-021-22695-y
在哺乳动物发育过程中，胎盘是第一个形成的器官，负责将胚胎固定在子宫上，并介导与母亲的营养和气体交换。胎盘在整个妊娠期间支持胎儿，胎盘缺陷是许多妊娠并发症的根源。然而，尽管胎盘对进化、发育和生殖健康具有重要意义，但对胎盘的研究还不够充分，通常在大规模的"组学"分析中被省略。例如，在基因类型-组织表达(GTEx)项目中的17382个样本中，没有一个是胎盘的，这是一项组织范围的基因表达研究。然而，胎盘功能障碍是孕产妇和围产儿发病率和死亡率的主要原因。在世界范围内，孕产妇和围产期死亡造成的死亡负担相当于癌症造成的总负担的一半左右。
RNA除了编码蛋白质外，还具有许多功能。例如，它们在细胞核和细胞质中都扮演着调节转录的多重角色。它们控制核结构，调节mRNA的稳定性、翻译和翻译后修饰。因此，了解目前存在的RNA谱系，有助于我们理解细胞和组织的功能。
先前的胎盘转录组分析集中在与母体和胎儿状况相关的差异上。最初的研究使用了微阵列分析，随后是最近的RNA-Seq。然而，这些研究在胎盘活检的数量和测序报道的深度方面是有限的。此外，早期的RNA-Seq研究大多使用寡聚dT启动的cDNA合成，这阻碍了非腺化RNA的分析，并针对microRNA(MiRNA)和PIWI相互作用RNAs(PiRNAs)等小转录本进行了选择。
胎盘RNA转录本的复杂性
图片来源：https：//doi.org/10.1038/s41467-021-22695-y
作者从302个人胎盘中分离出总RNA，按大小分级，并对耗尽的长RNA和小RNA进行了测序。首先描述了胎盘中不同类型的转录本，并与其他人类组织相比，分析了转录组的组成和复杂性。然后，然后作者重建了胎盘转录组，并报告了之前无法识别的编码和非编码转录本。作者发现在子痫前期(PE)和胎儿生长受限(FGR)病例中存在多种丰富的环状RNA(CircRNAs)，并提供了异常转录本的分析。最后，作者证明母体血清中一种由差异表达的mRNA编码的蛋白质--叶状素样蛋白3(FSTL3)的水平可以预测PE和FGR。
总之，在本研究中，作者报告了高质量的RNA-Seq数据，并对人类胎盘转录组进行了全面分析。(生物谷 Bioon.com)
参考资料
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