香港大学Kelvin Kai-Wang To 博士团队：纳米孔全基因组测序分析发现全球首例COVID-19康复患者二次感染
来源：NanoporeTechnologies 2020-11-17 12:34
8月，香港大学Kelvin Kai-Wang To 博士团队利用纳米孔手持便携式测序仪MinION进行全基因组测序，结合ARTIC和Medaka工作流程分析，发现全球首例COVID-19康复者二次感染病例，基因组学分析显示两次感染病毒不同。对两次感染的病毒基因组学进行分析发现首次感染的病毒基因组属于GISAID V分支、Nextstain19A分
8月，香港大学Kelvin Kai-Wang To 博士团队利用纳米孔手持便携式测序仪MinION进行全基因组测序，结合ARTIC和Medaka工作流程分析，发现全球首例COVID-19康复者二次感染病例，基因组学分析显示两次感染病毒不同。
对两次感染的病毒基因组学进行分析发现首次感染的病毒基因组属于GISAID V分支、Nextstain19A分支，穿山甲系B.2，二次感染的病毒基因组属于GISAID G分支、Nextstrain 20A分支和穿山甲系B.1.79。首次感染的病毒基因组由于开放阅读框8的第64位多了一个终止密码子导致基因组上产生了50个氨基酸的缺失，除此之外，两个病毒基因组还存在另外23个核苷酸的差异，其中有13个非同义突变引起氨基酸突变。两个基因组的氨基酸差异主要表现在棘突蛋白、膜蛋白、核蛋白、非结构蛋白（NSP3、NSP5、NSP6、NSP12）和辅助蛋白（ORF3a、ORF8和ORF10）。
8月25日，《临床传染病》（Clinical Infectious Diseases）接受了该团队题为“COVID-19re-infection by a phylogenetically distinct SARS-coronavirus-2 strain confirmedby whole genome sequencing”的文章。(生物谷Bioon.com）
【直播预告】纳米孔测序在人类遗传学和罕见病研究中的应用
【日期】2020/11/19 15:00
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