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新型犬冠状病毒:分离自东马来西亚一名住院肺炎患者

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来源:本站原创 2021-05-24 09:50

2021年5月21日讯/在对一种高度敏感的泛种冠状病毒(CoV)半巢式RT-PCR方法进行验证时,研究人员在2017-2018年马来西亚沙捞越301例住院肺炎患者中的8例(2.5%)鼻咽拭子样本中发现了犬CoV (CCoV) RNA。大部分患者为居住在农村地区的儿童,经常接触家养动物和野生动物。
2021年5月21日讯/在对一种高度敏感的泛种冠状病毒(CoV)半巢式RT-PCR方法进行验证时,研究人员在2017-2018年马来西亚沙捞越301例住院肺炎患者中的8例(2.5%)鼻咽拭子样本中发现了犬CoV (CCoV) RNA。大部分患者为居住在农村地区的儿童,经常接触家养动物和野生动物。


研究人员采用普通和特定的CoV和CCoV进行一步RT-PCR方法对标本进行研究,并在A72犬细胞中进行病毒分离。采用Sanger法进行全基因组测序。

研究发现,8份标本中有2份含有足够数量的CCOV,经不太敏感的单步RT-PCR检测证实,1份标本显示A72细胞存在细胞病变效应(CPE)。CPE病毒的全基因组测序鉴定为一种新的犬-猫重组甲型冠状病毒(II型),研究人员将其命名为CCoV-HuPn-2018。CCoV- hupn -2018的大部分基因组与CCoV TN-449更接近,而其S基因与CCoV- ucd -1 (S1域)和猫CoV WSU 79-1683 (S2域)的序列同源性明显更高。CCoV-HuPn-2018在N蛋白中有一个36 nt (12-aa)缺失,并且存在全长和截断的7b非结构蛋白,该研究结果可能有临床意义。


图 从A72细胞分离的CCoV-HuPn-2018免疫透射电镜图像

该研究首次从一个肺炎患者分离的新型犬-猫重组甲型冠状病毒。如果该病毒被确认为病原体,它可能是已知的第八种导致人类疾病的独特冠状病毒。该研究强调了动物冠状病毒对公共卫生的威胁,以及对它们进行更好监测的必要性。

(生物谷Bioon.com)

原文出处:Anastasia N Vlasova, PhD, Annika Diaz, Debasu Damtie, MS, Leshan Xiu, MS, Teck-Hock Toh, MD, Jeffrey Soon-Yit Lee, MD, Linda J Saif, PhD, Gregory C Gray, MD, Novel Canine Coronavirus Isolated from a Hospitalized Pneumonia Patient, East Malaysia,Clinical Infectious Diseases, 2021;, ciab456,https://doi.org/10.1093/cid/ciab456

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