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研究揭示海洋无脊椎动物RNA病毒的遗传多样性

  1. 病毒

来源:上海巴斯德研究所 2021-05-13 12:34

   《中国科学:生命科学》(SCIENCE CHINA Life Sciences)在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究员崔杰课题组题为Virome in Marine Ecosystems Reveal Remarkable Invertebrate RNA virus Diversity的研究成果。海洋蕴藏着丰富的资源

 

 

 

《中国科学:生命科学》(SCIENCE CHINA Life Sciences)在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究员崔杰课题组题为Virome in Marine Ecosystems Reveal Remarkable Invertebrate RNA virus Diversity的研究成果。

海洋蕴藏着丰富的资源,具有开发潜力;海洋生物安全问题同样需要引起足够的重视。海洋中不仅存在尚未被发现的动、植物物种,还存在数量更庞大、种类繁多的微生物。传统的海洋病毒研究多集中在以噬菌体为代表的DNA病毒上,对多样性高、基因组不稳定的RNA病毒的遗传多样性、分布特征及传播模式等均不清楚。

该研究中,研究人员从不同海域共采集到3门6纲58种的海洋无脊椎动物样品,并利用宏转录组的测序方法对不同物种的RNA病毒组进行研究。研究人员使用改进的生物信息分析方法,鉴定出涵盖9个病毒家族(Durnavirales、Totiviridae、Bunyavirales、Chuviridae、Picornavirales、Flaviviridae、Hepelivirales、Solemoviridae、Tombusviridae)的363个RNA病毒,其中的315个与已知的RNA病毒相似度较低,被认为是全新的RNA病毒。该研究首次报道了海洋汉坦样病毒,其较陆地汉坦病毒更古老,因此,提出了汉坦病毒可能具有海洋起源的假说。结合基因组结构和统计学分析,研究人员展示了丰富的海洋病毒遗传多样性和病毒基因组可塑性,揭示了不同海域间、不同宿主类别间可能存在的病毒传播现象。整体而言,该研究通过解析海洋无脊椎动物RNA病毒组,描绘病毒生态圈,为海洋RNA病毒的起源、进化、传播提供了重要见解。(生物谷Bioon.com)

 

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