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NEJM:张锋团队发布简易CRISPR新冠检测2.0版 提高检测灵敏度

  1. 病毒

来源:药明康德 2020-09-17 13:02

 今日,Broad研究所的著名学者张锋教授和合作伙伴一起,公布了他们进一步改良的基于CRISPR技术的新冠病毒简易检测流程。这一流程被称为STOPCovid.V2,此前,张锋团队和其合作伙伴已经公布了称为STOPCovid的简易新冠病毒检测流程,这一流程不需要从患者样本中纯化RNA,并且将检测新冠病毒所需的化学反应步骤在一个试管中完成。2.0版的S

 

今日,Broad研究所的著名学者张锋教授和合作伙伴一起,公布了他们进一步改良的基于CRISPR技术的新冠病毒简易检测流程。这一流程被称为STOPCovid.V2,此前,张锋团队和其合作伙伴已经公布了称为STOPCovid的简易新冠病毒检测流程,这一流程不需要从患者样本中纯化RNA,并且将检测新冠病毒所需的化学反应步骤在一个试管中完成。

2.0版的STOPCovid在原有检测的基础上更进一步,在样本制备的过程中通过加入磁珠富集样本中的RNA,从而通过提高PCR反应的起始RNA数量,进一步提高了STOPCovid.V2的检测灵敏度。

在最初的STOPCovid检测流程中,张锋团队将扩增RNA数目的等温PCR步骤和使用Cas酶检测新冠病毒特定序列的化学反应合并在同一个试管中进行。这一检测步骤不需要复杂仪器,只需要在60摄氏度的恒温反应,就可以通过侧流试纸读出检测结果。然而,在进一步检测中,研究人员发现,这一简易版流程只能发现60.5%传统RT-PCR检测出的阳性患者。

为了提高检测的灵敏度,STOPCovid.v2的流程中加入了通过磁珠富集鼻咽拭子中新冠病毒RNA的步骤,使用普通实验室中用于富集RNA的磁珠,研究人员可以收集鼻咽拭子中包含的所有病毒RNA作为反应的起始材料,而且研究人员同时精简了磁珠富集RNA的操作步骤,去除了乙醇清洗和洗脱过程,让整个RNA富集过程不超过15分钟。

研究人员在文章中表示,这一简化版的STOPCovid.V2流程适于没有复杂仪器的临床实验室使用。同时,研究人员还开发了一款智能手机app,帮助检测人员对侧流试纸的结果进行解读。(生物谷Bioon.com)

 

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