新研究表明COVID-19疫情或始于2019年10月至12月
来源：本站原创 2020-05-18 21:01
2020年5月18日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自英国伦敦大学学院、帝国理工学院、牛津大学、法国留尼汪大学和法国国际农业研究中心的研究人员通过分析来自7500多名COVID-19感染者的病毒基因组，确定了SARS-CoV-2病毒基因组的多样性模式，从而为指导药物和疫苗靶标的发现提供了线索。他们在这种病毒中鉴定出了将近200个反复出现的基因
2020年5月18日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自英国伦敦大学学院、帝国理工学院、牛津大学、法国留尼汪大学和法国国际农业研究中心的研究人员通过分析来自7500多名COVID-19感染者的病毒基因组，确定了SARS-CoV-2病毒基因组的多样性模式，从而为指导发现药物和疫苗靶标提供了线索。他们在这种病毒中鉴定出了将近200个反复出现的基因突变，这突显了它可能如何适应和跳跃到人类宿主身上。相关研究结果近期发表在Infection, Genetics and Evolution期刊上，论文标题为“Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2”。
这些研究人员发现，在SARS-CoV-2的全球遗传多样性中，有很大一部分存在于所有重灾区国家，这表明从疫情早期开始，这种病毒就在全球范围内广泛传播，大多数国家都不存在单独的“零号患者”。
这些研究结果也进一步支持这种病毒在2019年末才出现，然后才迅速在全球范围内传播。这些研究人员通过对全球7500多名受感染患者的病毒基因组进行筛选，分析了SARS-CoV-2---导致COVID-19的新型冠状病毒---基因组多样性的出现。他们发现了198个似乎独立发生过不止一次的突变，这可能提供了这种病毒如何适应人类宿主的线索。
论文通讯作者、伦敦大学学院遗传学研究所的Francois Balloux教授说，“所有的病毒都会自然发生突变。突变本身并不是一件坏事，而且没有任何迹象表明SARS-CoV-2的突变速率比预期的快或慢。到目前为止，我们还不能说SARS-CoV-2的致死性和传染性越来越强，还是越来越弱。”
这些微小的基因变化或者说突变并没有均匀地分布在SARS-CoV-2病毒的整个基因组中。这些研究人员表示，由于这种病毒基因组中的某些部分很少发生突变，这些不容易发生突变的病毒基因组部分可能是开发药物和疫苗的更好靶标。
Balloux教授解释道，“战胜病毒的一个主要挑战是如果病毒发生了突变，那么疫苗或药物可能就不再有效。如果我们将精力集中在病毒基因组中较少发生突变的部分，我们就有更好的机会开发出长期有效的药物。我们需要开发不容易被病毒躲避的药物和疫苗。”
论文第一作者、伦敦大学学院遗传学研究所的Lucy van Dorp博士补充道，“病毒基因组之间的遗传差异或突变仍然很少。我们发现，其中的一些遗传差异在疫情爆发过程中多次发生，且彼此独立地发生---随着更多基因组的出现，我们需要继续监测这些遗传差异，并进行研究，以了解它们的确切作用。”
这些结果增加了越来越多的证据表明SARS-CoV-2病毒从2019年10月6日至2019年12月11日开始有一个共同的祖先，这也正是这种病毒从之前的动物宿主跳转到人类身上的时候。这意味着这种病毒在首次被发现之前很长一段时间内不太可能在人体中传播。
在包括英国在内的许多国家，采样到的SARS-CoV-2病毒的多样性几乎与全世界范围内所观察到的一样多，这意味着这种病毒多次独立地进入英国，而不是通过任何一个指示病例（index case）进入英国。
这些研究人员开发出一种新的交互式、开源的在线应用程序，这样全球各地的科学家们也可以评估病毒基因组，并应用类似的方法来更好地了解它的进化。
van Dorp博士说，“能够在疫情爆发的头几个月内分析如此多的病毒基因组，对药物开发工作可能是非常有价值的，这表明即使是在过去十年内，基因组学研究也已经取得了很大的进展。全球数百名科学家一直在对病毒基因组进行测序并在网上公布，我们都从他们的巨大努力中受益。”（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Lucy van Dorp et al. Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2. Infection, Genetics and Evolution, 2020, doi:10.1016/j.meegid.2020.104351.
2.Lucy van Dorp et al. No evidence for increased transmissibility from recurrent mutations in SARS-CoV-2. bioRxiv, 2020, doi:10.1101/2020.05.21.108506.
3.Mutations in SARS-CoV-2 offer insights into virus evolution
https://www.sciencedaily.com/releases/2020/05/200505190550.htm
图片来自Infection, Genetics and Evolution, 2020, doi:10.1016/j.meegid.2020.104351。
这些研究人员发现，在SARS-CoV-2的全球遗传多样性中，有很大一部分存在于所有重灾区国家，这表明从疫情早期开始，这种病毒就在全球范围内广泛传播，大多数国家都不存在单独的“零号患者”。
这些研究结果也进一步支持这种病毒在2019年末才出现，然后才迅速在全球范围内传播。这些研究人员通过对全球7500多名受感染患者的病毒基因组进行筛选，分析了SARS-CoV-2---导致COVID-19的新型冠状病毒---基因组多样性的出现。他们发现了198个似乎独立发生过不止一次的突变，这可能提供了这种病毒如何适应人类宿主的线索。
论文通讯作者、伦敦大学学院遗传学研究所的Francois Balloux教授说，“所有的病毒都会自然发生突变。突变本身并不是一件坏事，而且没有任何迹象表明SARS-CoV-2的突变速率比预期的快或慢。到目前为止，我们还不能说SARS-CoV-2的致死性和传染性越来越强，还是越来越弱。”
这些微小的基因变化或者说突变并没有均匀地分布在SARS-CoV-2病毒的整个基因组中。这些研究人员表示，由于这种病毒基因组中的某些部分很少发生突变，这些不容易发生突变的病毒基因组部分可能是开发药物和疫苗的更好靶标。
Balloux教授解释道，“战胜病毒的一个主要挑战是如果病毒发生了突变，那么疫苗或药物可能就不再有效。如果我们将精力集中在病毒基因组中较少发生突变的部分，我们就有更好的机会开发出长期有效的药物。我们需要开发不容易被病毒躲避的药物和疫苗。”
论文第一作者、伦敦大学学院遗传学研究所的Lucy van Dorp博士补充道，“病毒基因组之间的遗传差异或突变仍然很少。我们发现，其中的一些遗传差异在疫情爆发过程中多次发生，且彼此独立地发生---随着更多基因组的出现，我们需要继续监测这些遗传差异，并进行研究，以了解它们的确切作用。”
这些结果增加了越来越多的证据表明SARS-CoV-2病毒从2019年10月6日至2019年12月11日开始有一个共同的祖先，这也正是这种病毒从之前的动物宿主跳转到人类身上的时候。这意味着这种病毒在首次被发现之前很长一段时间内不太可能在人体中传播。
在包括英国在内的许多国家，采样到的SARS-CoV-2病毒的多样性几乎与全世界范围内所观察到的一样多，这意味着这种病毒多次独立地进入英国，而不是通过任何一个指示病例（index case）进入英国。
这些研究人员开发出一种新的交互式、开源的在线应用程序，这样全球各地的科学家们也可以评估病毒基因组，并应用类似的方法来更好地了解它的进化。
van Dorp博士说，“能够在疫情爆发的头几个月内分析如此多的病毒基因组，对药物开发工作可能是非常有价值的，这表明即使是在过去十年内，基因组学研究也已经取得了很大的进展。全球数百名科学家一直在对病毒基因组进行测序并在网上公布，我们都从他们的巨大努力中受益。”（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.Lucy van Dorp et al. Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2. Infection, Genetics and Evolution, 2020, doi:10.1016/j.meegid.2020.104351.
2.Lucy van Dorp et al. No evidence for increased transmissibility from recurrent mutations in SARS-CoV-2. bioRxiv, 2020, doi:10.1101/2020.05.21.108506.
3.Mutations in SARS-CoV-2 offer insights into virus evolution
https://www.sciencedaily.com/releases/2020/05/200505190550.htm
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