Mol Cell：新技术或能捕捉早期病毒和宿主蛋白之间复杂的相互作用
来源：本站原创 2020-05-13 15:24
2020年5月13日 讯 /生物谷BIOON/ --70%以上的病毒会引发人类疾病，其中就包括引发人类COVID-19的SARS-CoV-2冠状病毒，其能通过拦截细胞“内部机器”来入侵机体，然而，目前研究人员并不清楚病毒的RNA是如何指挥宿主蛋白来进行自我复制的。图片来源：CC0 Public Domain近日，一项刊登在国际杂志Molecular Cell
2020年5月13日 讯 /生物谷BIOON/ --70%以上的病毒会引发人类疾病，其中就包括引发人类COVID-19的SARS-CoV-2冠状病毒，其能通过拦截细胞“内部机器”来入侵机体，然而，目前研究人员并不清楚病毒的RNA是如何指挥宿主蛋白来进行自我复制的。
图片来源：CC0 Public Domain
近日，一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中，来自范德堡大学的科学家们通过研究开发了一种新方法，其能识别出入侵的病毒RNA基因组与宿主蛋白之间发生的主要相互作用，这些事件对于病毒感染和细胞先天免疫力（即宿主机体第一道防线）都至关重要。
这种名为VIR-CLASP (VIRal交联和固相净化，VIRal Cross-Linking And Solid-phase Purification）的方法能够帮助研究人员更轻松地研究所有潜在的RNA病毒（而不是其RNA序列）。研究者Manuel Ascano博士表示，在感染早期阶段病毒-宿主之间相互作用的数量被认为相对较少，而这项研究中我们所揭示的是一种丰富的相互作用，其能够展现出整个过程的复杂性。
文章中，研究者能利用这种新方法发现病毒复制过程中的新型分子靶点，从而利用这些靶点开发出治疗病毒感染的新型疗法；首先研究者利用被独特类似物标记的RNA病毒来感染宿主细胞，随后利用特殊的光波长来照射细胞，促进类似物标记的病毒基因组与来自宿主细胞能与病毒基因组相互作用的蛋白质之间形成瞬时交联，这就能够帮助研究者捕捉感染发生期间的早期事件，而这些事件此前在科学研究过程中是无法获得的。
最后研究者表示，我们能对交联的RNA结合蛋白进行纯化，并利用蛋白质组学技术进行识别，继VIR-CLASP技术后再利用质谱技术，研究人员就能识别出能直接与基孔肯雅热病毒或甲型流感病毒结合的多种特殊蛋白质。（生物谷Bioon.com）
原始出处：
Byungil Kim, Sarah Arcos, Katherine Rothamel, et al. Discovery of Widespread Host Protein Interactions with the Pre-replicated Genome of CHIKV Using VIR-CLASP, Molecular Cell (2020). DOI:10.1016/j.molcel.2020.04.013
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