J biotech：早期检测败血症的里程碑发现

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来源：本站原创 2020-04-22 23:06

在最近一项研究中，来自 格拉茨大学计算生物技术研究所的研究人员开发出了一种突破性的方法：利用内源性信号（生物标志物），可以在第一个临床症状出现前两到三天就能准确地诊断出败血症。基于这种方法的检测，可以显著提高败血症患者的生存几率，并降低败血症患者的不良副作用。目前，研究人员已经在《Journal of Biotechnology》杂志上发表了两篇论文 "Ev

2020年4月23日讯/生物谷BIOON/---在最近一项研究中，来自 格拉茨大学计算生物技术研究所的研究人员开发出了一种突破性的方法：利用内源性信号（生物标志物），可以在第一个临床症状出现前两到三天就能准确地诊断出败血症。基于这种方法的检测，可以显著提高败血症患者的生存几率，并降低败血症患者的不良副作用。目前，研究人员已经在《Journal of Biotechnology》杂志上发表了两篇论文 "Evaluation of host-based molecular markers for the early detection of human sepsis "和 "Circulating cell-free DNA is predominantly composed of retrotransposable elements and non-telomeric satellite DNA"，研究人员对此进行了详细的介绍。

"我们的团队已经确定了24种生物标志物，与目前使用的检测方法相比，使用新开发的分类算法，可以在更早的阶段检测出细菌或真菌引起的败血症，"格拉茨大学计算生物技术研究所的负责人Christoph W. Sensen解释道。

在他们的工作中，生物信息学家们使用了由BioTechMed-Graz联合主任Robert Krause和格拉茨医科大学的Peter Neumeister领导的研究小组提供的匿名血浆样本的测序数据。这些样本分别来自于被诊断为细菌或真菌引起的败血症（在其血液中检测到这些病原体）、流感或淋巴瘤的患者以及健康人。这些测序数据形成了用于识别标记物的算法的开发基础，从而建立了一个新的数据库。

"这组数据可以用来区分处于败血症早期阶段的人和有早期临床症状的人，以及健康人和其他疾病患者。在为其开发标记物的患者组中，从首次临床体征出现前两天到目前使用的诊断方法诊断后两天这段时间内，诊断准确率接近90%。而在未纳入标记物开发的患者组的盲目研究中，准确率仍高达81%。" 因此，在这种方法的帮助下，败血症的诊断时间可以比其他诊断方法更早。

在研究过程中，研究人员还开发了一种新形式的定量实时PCR检测方法。基于PCR的检测方法已经在临床上得到了应用。这类检测方法通常用于扩增血液、血浆或血清样本中的感染性病原体的DNA或RNA，例如可以直接检测败血症患者的细菌或真菌。然而，鉴于可能导致败血症的病原体种类繁多，这只能在非常有限的范围内对败血症患者进行检测，因此非常不精确。另一方面，格拉茨小组新开发的检测方法主要是针对人体自身的信号，这些信号可以代表所有细菌和真菌的败血症的发生。因此，这些信号的测量精度要高得多，而且比直接检测病原体要早2-3天。（生物谷 Bioon.com）
 
资讯出处：Milestone for the early detection of sepsis

原始出处：Elisabeth Ullrich et al, Evaluation of host-based molecular markers for the early detection of human sepsis, Journal of Biotechnology (2020). DOI: 10.1016/j.jbiotec.2020.01.013

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