Nat Genet：重磅！科学家成功揭秘人类癌症基因组中“染色体碎裂”的奥秘
来源：本站原创 2020-02-13 09:43
2020年2月12日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中，来自哈佛医学院和欧洲分子生物学实验室的科学家们对癌症中新发现的染色体碎裂(chromothripsis或chromosome shattering)现象进行了最大规模的分析，这项研究是迄今为止同类研究中规模最大的一项研究，其包含了38种不
2020年2月13日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中，来自哈佛医学院和欧洲分子生物学实验室的科学家们对癌症中新发现的染色体碎裂(chromothripsis或chromosome shattering)现象进行了最大规模的分析，这项研究是迄今为止同类研究中规模最大的一项研究，其包含了38种不同癌症类型、涉及2600多个肿瘤的全基因组测序数据。
图片来源： Spencer Phillips/EMBL-EBI
染色体碎裂是一种突变过程，即在一个单一的灾难性事件中，一条染色的片段会经历大规模的重新排布，染色体的区域片段会破碎成为更小的片段并重新排列、连接并产生一种新的基因组配置；完全理解这些改变驱动癌症基因组的进化对于研究人员揭示癌症的发生和进展至关重要。研究者表示，在许多癌症类型中，染色体的碎裂事件远比我们认为的要普遍的多，他们能将染色体碎裂直接与癌症基因组的常见标志物联系起来，包括癌基因的扩增（增加促进癌症发生基因的拷贝）、肿瘤抑制基因的缺失（调节细胞生长和分裂）等。
研究者Isidro Cortés-Ciriano表示，我们将30多种癌症类型超过2600个肿瘤的全基因组测序数据进行整合，基于此我们发现，染色体碎裂和其它类型的复杂基因组重排在人类癌症中非常普遍，某些癌症类型的发生频率甚至超过了50%。利用全基因组测序数据库，研究人员就能深入理解癌症基因组中的染色体破碎事件，此前研究中，研究者利用低分辨率基于阵列的技术揭示了染色体碎裂在癌症和先天性疾病中所扮演的关键角色；这项研究中，研究人员还发现，这些染色体碎裂事件或许发生地更为普遍，同时他们还对多种癌症类型中大量基因组改变的模式进行了特性分析，并研究了参与DNA的修复机制。
研究者Peter Park说道，这项研究再次证明了大规模全基因组测序的力量，其或有望帮助更多科学家探索癌症基因组中令人困惑的基因组破碎的复杂特性，并在数百个病例中确定共同的特征。相关研究发现或能帮助研究人员更好地理解癌症发生及发展的机制以及人类肿瘤DNA的演变模式，其中有些改变具有非常重要的临床意义，其或能帮助研究人员开发治疗癌症的新型疗法。
研究者指出，染色体碎裂或能帮助塑造肿瘤基因组并导致肿瘤抑制基因的缺失，并放大驱动癌症进展的癌基因的表达，此外，染色体碎裂还与癌症患者预后不良直接相关，但研究人员希望能够进行更多诸如此类的研究来帮助理解染色体碎裂和大规模基因组改变所产生的影响，从而帮助改善后期癌症的诊断和治疗。（生物谷Bioon.com）
原始出处：
Cortés-Ciriano, I., Lee, J.J., Xi, R. et al. Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing. Nat Genet (2020). doi：10.1038/s41588-019-0576-7
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