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研究人员构建癌症eRNA表达图谱并揭示其在癌症临床中的应用

来源:科技部 2019-11-07 09:25

 

 

2019年10月8日,德克萨斯大学休斯敦健康研究中心的韩冷、李文博课题组合作在Nature Communications上在线发表题为“Transcriptionallandscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted therapy incancer”的研究。该研究构建了迄今为止最完整的癌症增强子RNA(eRNA)图谱并揭示了eRNA在癌症临床中的潜在应用。

该项研究通过检测eRNA在约1万名癌症病人及约1000个癌症细胞系中的表达构建了目前为止最全面的癌症eRNA图谱,揭示了eRNA的癌症特异性表达/癌症种系特异性表达的特征,同时强调了eRNA作为生物标记物在不同类型癌症临床上的应用。通过研究eRNA与转录因子之间的共表达关系,发现eRNA的特异性表达与转录因子特异性调控密切相关。通过分析eRNA与编码基因之间的基因组距离及表达相关性并结合多组Hi-C数据加以佐证,该研究构建了eRNA的调控网络,揭示了eRNA在调控致癌信号通路及调节癌症临床治疗基因中的关键作用。此外,该研究通过调查eRNA与抗癌化合物之间的关系,首次证实eRNA可影响癌症细胞对抗癌药物的敏感性和抵抗性,且该影响可能会关联到相关的一条或多条癌症信号通路。

这项研究拓展了该领域对癌症基因转录调控的认知,探索了基于靶向eRNA的癌症治疗及联合治疗方案,开拓了癌症治疗新思路。  (生物谷Bioon.com)

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