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液体活检成功检测MSI和TMB 它们能够预测对免疫疗法的反应么?

来源:药明康德 2019-09-13 06:34




靶向PD-1/PD-L1的癌症免疫疗法已经成为多种癌症的标准疗法。但只有约20%-30%的患者对免疫检查点抑制剂有反应,如果在患者用药之前就可以通过生物标志物来识别合适的患者,那么对临床医生和患者的决定都将起到重要的帮助。

于本月发表在Clinical CancerResearch期刊上的一篇文章显示,一项液体活检可以检测微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI),以及肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)两种生物标志物,它们与免疫检查点抑制剂疗法的无进展生存期(PFS)相关。

微卫星是在编码和非编码区域沿基因组分布的重复DNA序列,由长度为1~6个碱基的序列重复构成。微卫星的重复性使其对于DNA错配特别敏感。MSI是由DNA错配修复功能缺陷引起的遗传性突变状态,其特征是微卫星突变的累积。MSI是错配修复功能不正常的表型证据。

TMB指外显子区域上平均1Mb碱基出现的体细胞非同义突变数量。癌细胞TMB越高,可能产生的新抗原越多,因此肿瘤的抗原免疫原性越高,可能更加适合免疫治疗。

在这项研究中,研究人员试图评估基于个人基因组诊断开发的液体活检方法的敏感性和特异性。液体活检测试可以覆盖更大的患者群体,例如组织采集受限或对额外手术干预存在安全问题的患者。研究人员开发了一个包含58个基因的泛癌检测矩阵,然后采用多因子纠错方法和一种新的峰发现算法(peak-finding algorithm)来发现血液中无细胞DNA(cfDNA)里出现MSI移码的等位基因。如果确定20%或更多的基因位点具有MSI,则将样品分类为MSI高。

对于MSI,该液体活检测试的特异性大于99%,灵敏度为78%。对于TMB,该液体活检测试的特异性大于99%,灵敏度为67%。

研究人员发现,在正在接受免疫检查点抑制剂治疗的患者中,在基线cfDNA中直接检测到MSI与患者的PFS相关。但对总体生存率的改善没有达到统计显着标准。

本次文章的第一作者Andrew Georgiadis先生表示:“我们的数据表明,MSI和TMB的液体活检分析可能比存档的组织样品更能预测免疫治疗反应,因为它既是实时测量又是全身测量,并解决了组织活检的固有采样偏差问题。”(生物谷Bioon.com)

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