Nat Commun：开发出一种高效诊断多种癌症亚型的新技术
来源：本站原创 2019-04-04 08:56
2019年4月4日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中，来自澳大利亚加文医学研究所的科学家们通过研究开发了一种潜在的诊断方法，其或能对癌症样本中的融合基因（fusion genes）进行检测，融合基因与五分之一的癌症有关，同时这种新方法还能对癌症中存在的重排DNA进行准确检测，相比当前方法而言，其能为癌症患者提供更为合适的
2019年4月4日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中，来自澳大利亚加文医学研究所的科学家们通过研究开发了一种潜在的诊断方法，其或能对癌症样本中的融合基因（fusion genes）进行检测，融合基因与五分之一的癌症有关，同时这种新方法还能对癌症中存在的重排DNA进行准确检测，相比当前方法而言，其能为癌症患者提供更为合适的个体化治疗建议。
图片来源：Garvan Institute
我们的DNA能提供细胞维持功能的代码，这些代码的特定改变会驱动癌症进展，其中一种改变就是基因发生“融合”，当DNA以一种特殊的方式破碎并重连时，通常来自染色体的不同DNA片段上基因会重新结合在一起；这些融合基因能产生编码蛋白的异常转录代码，从而促进肿瘤形成，这种状况估计与五分之一的人类癌症发生直接相关。
利用标准的临床诊断方法（比如荧光原位杂交技术（FISH）等）能对包括白血病和肉瘤等多种癌症中的融合基因进行筛查，研究者Jim Blackburn博士表示，用于检测融合基因的标准FISH诊断工具已经在临床上使用了大约30年，但每一个测试只能够提供关于一个融合基因的检测结果，无法给出完整的融合基因的检测情况；当前的方法往往无法检测一些不常见的融合基因。
这项研究中，研究者所使用的新方法能够抹去癌症在哪里被发现的相关信息，他们会从更广泛的角度来研究已知的与所有癌症亚型融合有关的基因，为了开发这种新方法，研究者调查了是否对癌细胞的RNA进行测序就能够提供比FISH技术更加准确的融合基因信息，随后研究者设计出了两种更为广泛检测盘来作为工具帮助筛选已知所有融合基因的RNA，其中一种检测盘应用于血液癌症，另一种则用于实体瘤。
研究者利用临床癌症患者样本验证了这种新方法，他们发现，对RNA的分析不仅能够准确检测到FISH技术所鉴别出的融合基因，还能够鉴别出FISH技术无法识别到的超过20%的融合基因。研究者希望这两种诊断技术能够更好地帮助诊断癌症中的融合基因。如今科学家们已经开发出了针对某些融合基因的靶向性疗法，一个典型例子就是抗癌药物larotrectinib，其能降低NTRK基因与其伴侣基因融合后编码的过度反应酶类的活性，指定特殊的癌症疗法需要识别出正确的融合基因。
后期研究人员还将进行更为深入的研究鉴别出更多的融合基因，从而帮助更加准确地对患者进行高效诊断，并为其提供新型的个体化疗法。（生物谷Bioon.com）
原始出处：
Heyer EE, Deveson IW, Wooi D, et al. Diagnosis of fusion genes using targeted RNA sequencing. Nat Commun. 2019 Mar 27;10(1):1388. doi: 10.1038/s41467-019-09374-9.
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