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Nat Methods:构建出细胞糖文库GAGOme,有助于探究糖胺聚糖在人体中的生物学功能

来源:本站原创 2018-08-16 07:18

2018年8月16日/生物谷BIOON/---被称作糖胺聚糖(glycosaminoglycan, GAG)的糖结构存在于人体的几乎所有组织中,并且在很多疾病中发挥着重要的功能。鉴于缺乏理解这些糖结构的工具,人们对它们的理解是有限的。如今,在一项新的研究中,来自丹麦哥本哈根大学的研究人员开发出这样的一种工具:细胞糖文库(cellular library of sugars)。相关研究结果于2018年8月13日在线发表在Nature Methods期刊上,论文标题为:“The GAGOme: a cell-based library of displayed glycosaminoglycans”。
图片来自Nature Methods, doi:10.1038/s41592-018-0086-z。

我们大多数人倾向于将糖视为营养危害物。然而,糖是人体中的必不可少的组分;它覆盖着我们的细胞和蛋白的表面,并调整了我们的组织在健康和疾病中的行为和功能。

GAG是一类在人体的几乎所有组织中发现的糖。其中的一些糖已被用作血液稀释药物或作为预防炎症的手段。然而,人们总体上仍然缺乏对这些糖所发挥的作用的理解。这其中的部分原因在于科学家们没有有效的工具来一次一个结构地研究这些糖结构。

如今,这些研究人员成功地将这些糖结构呈现在所谓的“糖文库”中。这种被称作GAGOme的糖文库由经过基因改造的细胞组成,而且这些细胞呈现出确定的GAG结构变化。

论文第一作者、哥本哈根大学糖组学中心博士后研究员Yen-Hsi Chen说,“我们知道这些糖结构是比较重要的,不过我们才刚刚开始了解它们的重要性,通过什么方式发挥作用。因此,如果顺利的话,我们的新工具将能够让我们获得新的知识以及将这些知识应用于各种疾病中。”

这些研究人员使用CRISPR/Cas9---通常称为“基因剪刀(genetic scissor)”---基因编辑技术移除或导入参与GAG合成的特定酶。这使得他们能够产生大量的细胞来展示几乎所有的GAG修饰类型。

GAGOme将允许研究人员测试特定的硫酸化修饰模式或者具有确定长度的糖链组成的生物学功能。这些研究人员还设想这种文库可用于合成含有确定的GAG糖链的蛋白和潜在的药物。(生物谷 Bioon.com)

参考资料:

Yen-Hsi Chen, Yoshiki Narimatsu, Thomas M. Clausen et al. The GAGOme: a cell-based library of displayed glycosaminoglycans. Nature Methods, Published Online: 13 August 2018, doi:10.1038/s41592-018-0086-z.

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