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从检验医学角度出发,中国专家液体活检研究脱颖而出

来源:基因谷 2018-07-18 18:04


小编推荐会议:2018液体活检新技术与临床应用论坛 

 

在基因检测兴起之时,两个疑问就一直徘徊在脑海:

一、基因检测技术基本都是由生物技术专家研发,都兴起于生物技术公司,目前基本上所有的基因检测公司的创始人也都是生物技术领域的科学家和资深人士,但基因检测要走向市场,就需要建立医学检验所,而医学检验所的检测人员国家明文规定的是需要医学检验资质的医学检验技术人员。目前,这是一个矛盾,技术上自然是生物科技专家更具实力,但作为临床的检测项目,就是医学检验项目,需要由医学检验专业人员掌控,谁更适合作为主角?

二、基因检测要应用于临床,就绕不开医院,在目前三级医院无论是经济实力还是人员能力都很强的情况下,尤其是生物科技公司更注重技术带来的商业价值,而医院则更注重临床检验项目的质量和规范,有条件、有时间和人力去完善技术的临床应用阶段时,这些从基因检测公司走进医院的项目,会不会被大型公立医院收编,自行开展?

4月15日,美国癌症研究协会(AmericanAssociation for Cancer Research,AACR)2018年年会上,由上海市胸科医院娄加陶主任主持的肺癌EGFR/KRAS/BRAF ctDNA-NGS多中心性能验证项目,经过AACR专家委员会层层甄选后,成为液态活检分论坛(mini symposium: liquid biopsy1)上分享的唯一一个以中国专家为主导的科研项目。

该研究由上海市胸科医院娄加陶主任主持,吉林大学第一医院肿瘤中心、中山大学肿瘤医院肿瘤放射科等专家共同参与,通过多中心的临床样本收集和测试,从标准品、癌症患者血样、健康人血样等多方面,参照血浆数字PCR及组织ARMS同步检测结果,综合评估ct-DNA EGFR/KRAS/BRAF扩增子测序的检测性能。

虽无“免疫治疗”、“肿瘤早期筛查”等行业热点的加持,该研究项目却能在众多液态活检研究中脱颖而出,获得AACR专家委员会的青睐。在分论坛上详细解读了这一研究的临床意义。

【重视性能验证,获AACR青睐】

放眼目前ctDNA检测行业,在资本的驱动下,有大部分ctDNA检测都过早地进入了临床应用,而忽视了测试的性能验证和质量控制,造成检测结构的差异性,这项研究适时弥补了这一临床运用的缺陷。

从PCR技术问世到技术成熟应用于临床经历了数十年的发展和大量临床研究的积淀,才得以作为临床普及的检测技术,而广泛应用于肿瘤等重大疾病的诊断和治疗。反观ctDNA-NGS技术,同样需要时间的积淀与临床研究的验证,过早将不成熟的新技术应用到临床实践中,不仅弊大于利,还可能埋下巨大的隐患。

本着为提升临床服务能力,努力使临床实践以医学证据为基础,立足于“准确性”与“临床有效性”这两个关键点,对ctDNA-NGS试剂盒进行性能验证,不仅通过严格控制的随机对照实验考量其技术平台是否准确可靠,还要求其检测结果必须具有临床使用的价值和意义。

在前不久,美国临床肿瘤学会(ASCO)和美国病理家学院(CAP)发表的联合评论中称,ctDNA的临床应用之所以还未能达到成熟的阶段,最主要的原因之一,就是很多采用ctDNA开展临床应用研究的工作,并没有建立在对所采用的ctDNA检测方法充分的实验室性能确认及临床性能确认基础之上。该项研究,是在这一方向上的努力与尝试,也是获得AACR专家委员会认可的主要原因。

【从检验医学角度出发,树立性能验证模版】

该项研究的思路,充分从检验医学的角度出发,树立了一个极具代表性的NGS检测方法性能验证的范例。在ctDNA检测中,毫无疑问,性能验证和临床实用性验证是必不可少的,验证的结果将决定ctDNA检测在肿瘤精准治疗领域的应用前景。但ctDNA检测及性能验证流程尚未标准化,往往因不同公司和学术机构而异。

该项研究不仅仅针对肿瘤患者临床血液样本,还选用cfDNA标准品及空白对照组,实验设计较为严谨,用于比对的检测方法较有代表性,样本收集贴近临床,可作为NGS检测方法性能验证的范例,被更多实验室借鉴,以验证不同的ctDNA检测技术的性能,为提升液态活检临床验证程序的规范性与可重复性助力,从而使ctDNA-NGS检测为临床提供准确的结果。

【演讲内容摘要】

该研究采用安可康?EGFR/KRAS/BRAF 扩增子测序试剂盒,共分析了134位非小细胞肺癌患者及50位健康人的血浆cfDNA样本,并将结果与肿瘤组织ARMS技术及cfDNAddPCR技术检测的结果进行比较。结果表明,ctDNA-NGS显示出优越的灵敏度与特异性。当cfDNA样本量为20ng、AF值(等位基因频率,AlleleFrequency)为0.1%时,平均检出率为100%,同时所有空白对照样品均未检出“假阳性”。在组织和血浆突变检出一致性上,采用ctDNA-NGS测定的治疗前cfDNA样本中EGFR突变与匹配的肿瘤组织ARMS检测结果一致率为94%,与cfDNA ddPCR检测结果一致率为98%。在定量准确性层面,ctDNA-NGS与cfDNA ddPCR技术相比,AF一致性(R2)为0.95。在该研究中,我们还发现可检测多个PCR检测方法无法检出属于19del类型的denovo突变,体现了ctDNA-NGS的临床运用的良好前景。

娄加陶教授团队

从检验医学角度出发,中国专家液体活检研究脱颖而出

在公立医院检验科,像娄加陶教授这样,既懂基因检测技术,又熟知医学检验技术的,在全国来说也是极少数,在第三方医学检验所,能够掌握两者的医学检验人才更是凤毛麟角。目前来说,基因检测的主力军还是生物科技人才,但随着医院和检验人员越来越多的接触到基因检测技术,未来基因检测这一新兴科技,会不会是医学检验人员掌控大局,医院检测成主流?(生物谷Bioon.com)

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