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NovaSeq正式入驻烈冰实验室,八周年感恩回馈拉开序幕

来源:生物谷 2018-04-17 09:32

NovaSeq一路飘洋过海,近日正式入驻烈冰科技实验室,已完成测试,正式投入使用。烈冰八周年的感恩回馈活动也拉开序幕!

  
NovaSeq开启高通量测序新纪元

2017年测序行业巨头Illumina推出了“测序洗衣机”型号-NovaSeq,成为了该年度测序行业最大的新闻。NovaSeq系统作为测序界的“网红”,具有可扩展的通量和测序灵活性:2天内最高可产生6TB的数据。

NovaSeq系列是Illumina迄今为止推出的最为强大的测序仪,几乎可覆盖目前所有测序需求,将是临床研究的一个关键突破,为对深度有极高要求的罕见基因变异检测开启更高性能的全新市场。除了一次运作最高能够对48人的全基因组进行测序,NovaSeq系统还将为比对肿瘤-健康组织的超级深度测序(ultra-deep sequencing)、复杂疾病相关的大规模基因变异分析等领域提供全新的市场。

NovaSeq让数据产出、完成时间与结果相匹配,让每个样本的成本符合研究需求。该平台重新定义了高通量测序,具有无与伦比的吞吐量、使用便捷、成本低以及灵活性高等显著优势。NovaSeq作为Illumina推出的测序仪的历史之最,设计旨在允许广泛的研究人员能够使用下一代测序技术,更容易地开展更大样本量、更大广度及深度的大规模基因组学项目。NovaSeq的引入,也是烈冰推出NovelBrain?云计算平台之后,八周年之际对测序实验平台的进一步完善,大大提升烈冰大数据大样本的测序分析服务能力。

目前,烈冰拥有NovaSeq、PacBio Sequel、MiSeq、NextSeq 500、Life Ion Proton和S5XL 等一系列测序平台,全面的高通量测序平台,与烈冰严谨的实验室SOP管理相辅相成,再加上已完成V3.1升级的NovelBrain®云计算分析平台,为客户提供严谨合理的定制化服务。

  
实验室管理进一步完善

烈冰科技拥有国际成熟的管理和服务体系,以及先进的测序检验设备,汇集大批技术与管理人才,具备标准的生产流程、完善的质控体系及高素质的检验人员,与国内外高水平科研医疗机构和临床专家开展广泛合作。

 

烈冰的实验室采用NovelBrain®云计算的实验管理和样本管理系统进行智能化管理,实验管理模块中详细记录了本次实验的物种、样本名等实验基本信息,同时样本存储位置的录入精确至冰箱的隔层。实验进程详细划分为收样、抽样、建库、上机四个步骤,每个步骤完成后主动提示相关负责人,还可查看各步骤的操作人员和实验结果相关图片,责任到人,大幅提高实验室管理效率,并保证样本的准确性。

   
NovelBrain®云计算平台再升级

烈冰一直以“Novel”为准则,向大家传递新的知识、新的方法、新的技术,以及新的产品。作为烈冰科技耗时八年推出的重量级产品,NovelBrain®云平台更是致力于向所有科研和医疗行业工作者提供最新的、最便捷的、最高效的数据分析体验,让每一个普通人都可以轻松了解自己数据的价值,并赋予数据生物学意义。

为了配合NovaSeq的到来,不断进行自我更新,增加大数据分析计算产能,完善平台运行机制,成为了NovelBrain®云平台持续发展的必要环节。事实上,NovelBrain®的研发团队一直在努力,1月初更新的V3.0版本上线了GCN(基因功能网络绘制软件),增加了自动化弹性结果报告系统,完善了最科学最前沿的生物信息学工具和人机交互文档,同时还实现了人类基因组重测序分析的大幅度加速,4小时即可完成单样本的分析,打破了人重分析的瓶颈。

     
针对不同需求的用户,平台主要做了以下几点改进:
1.提供了更准确和易懂的各类文档。帮助用户在毫无生信基础的情况下,也能轻松上手平台操作,快速准确灵活地整合生物信息软件及Pipeline;
2.增加了大量最前沿的分析工具。不仅涵盖有甲基化、宏基因组、群体遗传和单细胞测序等分析,同时还紧追国际最新进展,定制化开发了生物学意义挖掘模块;
3.重点加强了报告可视化,可读性和关联性更强,可自动浏览结果报告。上线了独立自主开发的GCN功能网络可视化软件,可以在结果中直观展示生物学意义的功能传导路径。增加了自动化结果报告判读系统,方便医疗客户在报告中快速了解临床信息;
4.自主开发NB三重调度加速框架,最终实现了人类重测序分析的大幅度加速,4小时即可完成单样本的测序分析,较传统的分析方法提高了十多倍速度。

本月,再次更新升级的V3.1版本携研发版和生产版惊艳问世,实现了NovelBrain®云平台里程碑式飞跃!针对大型研究室、测序工厂和企业用户,NovelBrain®云平台V3.1额外升级了一系列的功能,降低了第三方软件上线的工作量。针对科学研究的复杂性和可重复性,舍去复杂的文件配置,一键命令即可添加第三方软件上线;对虚拟镜像管理界面进行了全方位优化,Docker镜像管理一体化;本着跨界共享的精神,开放了众多平台接口,更灵活地进行平台对接,随心所欲地进行软件二次开发。生产版本上传task更便捷,研发版本测试环境更优越。

全面的高通量测序平台及高度自定义的分析平台,表明烈冰面对大样本大数据已做足准备,高效助力科学研究,为基因组研究提供更新、更快、更全的平台支撑;进一步发挥行业领先优势,为科学研究和精准医疗领域的研究人员提供各类科研及应用的定制化测序分析服务,满足研究人员各类科研及应用的差异化需求。

烈冰八周年回馈活动即将正式开启,详情请关注“烈冰生物”微信公众号。新的八年,新的考验,烈冰陪您继续前行!
 
 
关于烈冰

烈冰科技于2010年成立至今,身经百战,数百篇文献支持。8年间历经海量数据检验,已为600+国内外机构服务5000+项目,业务领域覆盖科研机构、大型药厂、医院、检验机构等。从国内首篇circRNA研究文章(Sci Rep. 2016 Mar 2;6:22572.)到首个人类血液外泌体长链RNA数据库exoRBase(www.exoRBase.org),从基于Ion Proton测序仪的第一篇转录组文献(BMC Med Genomics.2014 Aug 9;7:49)到第一篇高分转录组文献(Nature. 2016 Feb 4;530(7588):98-102,烈冰科技身经百战,不惧考验,最懂科研!

   
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