新功能、新界面、新体验,扫描即可下载生物谷APP!
首页 » 组学 » Science重大突破!单细胞测序平民化,测一个细胞仅需一美分,一次能测上千个细胞!

Science重大突破!单细胞测序平民化,测一个细胞仅需一美分,一次能测上千个细胞!

来源:本站原创 2018-03-20 23:20

2018年3月19日讯 /生物谷BIOON /——来自艾伦学院和华盛顿大学的科学家们开发出了一种廉价的高级技术可以检测成百上千个细胞的基因表达。这项基于配位的转录组测序技术(Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing,SPLiT-seq)是一项可延展的用于表征单个细胞RNA水平的技术,可用于鉴定脑部疾病及其他组织中的不同细胞类型,这项研究于近日发表在《Science》上。


图片来源:Allen Institute

“研究任何的多细胞生物系统,我们都需要明白它的基本组件——细胞。”艾伦学院科学家Bosiljka Tasic说道。“大脑包含很多不同形状和大小的细胞,但是现在却没有一种方法可以表征它们并进行分类。在单细胞水平鉴定RNA是一种鉴定细胞的方法,但是现有的技术太昂贵,且需要特殊的设备。由于SPLiT-seq可以通过任何实验室的基础设备完成,因此它将广泛应用于单细胞转录组学研究。”

过去开发的测序技术需要在进行基因标记之前分离单个细胞。而采用SPLiT-seq就不需要再分离细胞了。取而代之的是,细胞本身就被作为了一个自身RNA的分离器。研究人员可以同时将大量细胞进行RNA标记,这个过程需要重复多次,以保证每个细胞都具有一组独特的组合标签。这使得研究人员可以同时对大量的细胞进行基因表达的测序,并将它们进行分类。

“在这个项目中,我们使用SPLiT-seq对正在发育的小鼠大脑和脊髓中超过150000个细胞进行了测序,我们发现了许多特殊细胞类型的新的分子标记物。”华盛顿大学电气工程系合成生物学家、Paul G.Allen计算科学和工程学院Georg Seelig教授说道。“我们的实验成本为每个细胞一美分。SPLiT-seq显著降低了实验室进行单细胞测序的障碍,同时不需要昂贵的特殊设备。”

“任何疾病,包括阿尔兹海默症和帕金森,都起始于某些细胞的功能异常。”Tasic说道。“探索是哪些细胞以及哪些基因出错将帮助我们更深入地了解这些疾病的起因及进程,有利于我们开发新的治疗方法。”(生物谷Bioon.com)

参考资料:

Georg Seelig et al. Single-cell profiling of the developing mouse brain and spinal cord with split-pool barcoding. Science, 2018; eaam8999 DOI: 10.1126/science.aam8999

版权声明:本文系生物谷原创编译整理,未经本网站授权不得转载和使用。如需获取授权,请点击
温馨提示:87%用户都在生物谷APP上阅读,扫描立刻下载! 天天精彩!


相关标签

最新会议 培训班 期刊库