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中国农科院特产所首次破译鹿科动物全基因组序列

来源:中国科学报 2017-11-15 12:22

 

 

近日,由中国农业科学院特产研究所研究员李光玉带领创新团队在国际上首次破译鹿科动物全基因组序列。驯鹿全基因组测序的完成,不仅为研究人员从基因组水平挖掘驯鹿生长、代谢和抗寒等重要性状的分子机制提供了科学指导,而且为驯鹿驯化历史、基因组演化、群体遗传及鹿类动物的进化等理论研究奠定了重要基础。相关研究成果于11月1日在线发表在GigaScience上。

我国是鹿类动物资源最为丰富的国家,分布约有20种鹿类动物,而驯鹿是最具代表性的鹿科动物之一,是鹿科物种中唯一被驯化、雌雄个体均生长鹿角的动物。角的分枝繁复是其外观上的重要特征。长角分枝繁复,有时超过30叉,蹄子宽大,悬蹄发达,尾巴极短。驯鹿的身体上覆盖着轻盈但极为抗寒冷的毛皮。不同亚种、性别的毛色在不同的季节有显着不同,从雄性北美林地驯鹿在夏季时的深棕褐色,到格林兰岛上的白色。主要毛色有褐色、灰白色、花白色和白色。花色中白色一般出现在腹部、颈部和蹄子以上部位。鉴于该物种独特的生物学特征和重要的科研价值,研究人员对一只雌性驯鹿进行了全基因组测序并获得了高质量的组装序列,基因组大小为2.64Gb,Contig N50和Scaffold N50分别为89.7kb和0.94 Mb;基于同源比较和从头预测的方法,注释得到了21555个蛋白编码基因、159个rRNA、863个tRNA、547个miRNA和1339个snRNA。系统发育分析表明,驯鹿与牛科物种的分化时间大约在2950万年前,进一步的比较基因组学分析识别了335个驯鹿所特有的基因家族。

该项研究得到了中国农科院科技创新工程和国家自然科学基金等项目的资助,研究成果在线预发表期间即受到了广泛关注,并且荣获第十二届国际基因组大会GigaScience前沿研究奖。(生物谷Bioon.com)

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