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Hyperion™组织质谱成像技术<第一季> —— 颠覆组织样本研究思路

来源:生物谷 2017-11-03 18:03

在日常科研和临床研究中,经常困扰工作人员的一个难题就是:手里拥有大量的组织样本资源,却苦于找不到合适的方法充分发挥这些样本的价值,特别是一些珍贵的稀有样本,一旦损失了就无法补救!

   
现有组织样本分析方法的瓶颈

如何充分利用、全面分析组织样本是研究中经常遇到的问题。传统方法中常见的分析手段如:(荧光)免疫组化技术、流式细胞技术、高内涵组织分析技术等虽然也在不断优化,但仍然无法从根本上解决组织样本分析的诸多难题,例如:

1.样本量不足

2.单样本检测通道少

3.连续切片造成的数据差异

4.连续染色造成的数据丢失

5.单细胞制备过程丧失了蛋白间、细胞间的相互作用信息

6.复杂流程中难以避免的误差或人为错误

7.……

特别是在个性化诊断、精准医疗、大数据等新兴领域快速兴起,肿瘤、免疫等传统研究迅猛发展的大环境下,如果能充分开发利用医院、检验中心、科研院所、样本库等单位所保存的、长期以来积累的大量FFPE样本或新鲜分离的组织标本,通过这些样本进行疾病种类鉴定、机理分析、病程跟踪、个体化差异检测等研究,势必会为基础科研和临床诊疗提供大量创新的数据类型和理论基础,避免研究人员捧着金饭碗却要饭吃的窘境。

   
Hyperion系统改变组织样本分析思路 —— 充分发挥组织样本的珍贵价值

  
技术介绍
Hyperion组织质谱成像系统为研究复杂的细胞表型及细胞在癌症、肿瘤免疫和免疫介导疾病等微环境中的相互关系提供了前所未有的可视化研究方法。

系统的开发基于成熟稳定的Fluidigm® CyTOF®质谱流式技术,利用高度纯化的金属元素取代荧光基团作为标签,直接在石蜡包埋(FFPE)和新鲜冰冻组织切片样本上进行标记;并利用质量谱代替可见光谱进行检测,大幅超越了目前市场上已有方法的局限性。单次实验数据量的提高允许研究人员有足够的样本对比分析不同疾病类群间、相同疾病不同个体间、同一个体不同疾病时期间、不同外界环境下的个体差异等。

该系统为组织层面的多参数蛋白检测建立了新的标准。研究人员可以同时对4 - 37个蛋白标记物进行成像检测分析;大幅提高检测通道的同时将背景噪音降到最低;系统多达135个检测通道,充分满足研究人员未来不断增长的实验需求;并在最大限度上利用单个样本进行数据采集和分析,非常适用于珍贵的稀有样本;更重要的是,该方法有效地避免了因连续切片造成的样本间差异以及由于连续染色造成的数据间差异;此外,通过保留组织结构和细胞形态学信息,研究人员可以在组织微环境下从亚细胞水平获得全新的研究视角。


技术特点

1.适用于多种样本类型 —— 直接利用石蜡切片(FFPE)、冰冻组织切片以及细胞涂片进行标记检测,特别适用于稀有样本;

2.多参数综合数据 ——单张切片可同时对4 - 37个蛋白标记物进行检测分析;

3.数据准确 —— 多参数分析避免了连续切片以及连续染色造成的数据间差异和样本丢失;

4.保留组织结构 —— 亚细胞水平充分认识蛋白和相对应的细胞在组织结构中的分布与相互作用关系;

5.探索未知细胞亚群 —— 利用已知抗体标记物,实现未知数据的发掘!

   
数据分享:

组织分布和定位在很大程度上可以直观反映出哪些蛋白间或细胞间存在可能的相互作用关系;通过组织质谱成像系统可以轻松获得蛋白及其相对应的细胞在组织中的定位分布。参数的增加提高了单次检测的数据产出,可以在众多marker中挑选感兴趣的进行灵活组合、对比;更重要的是当我们把大量蛋白放在一起检测时,往往会带来意想不到的惊喜。有些结果是我们在单独检测时无法得到的。

近期内访问Fluidigm公司官网cn.fluidigm.com,您即可看到利用Hyperion平台获取的数据 ——通过MCD Viewer软件转换成的高质量TIFF格式图像,每张图像都可以通过光谱分离技术单独显示其中一种蛋白质的表达状态。

点击主页所示图片下方的箭头(图中白色方框内)选择所需标记物名称,即可在图中显示其在组织中的分布和表达情况(图1- a,b,c),或同时将3种不同标记物合并显示(图1- d);也可根据您的需要从数十种标记物中挑选您感兴趣的进行组合(图2)。以下所有数据都是源自同一张肺癌组织切片的检测结果。


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敬请期待:HyperionTM组织质谱成像技术<第二季> —— 已有用户经验分享

在下一季中,我们将通过采访记录和视频资料与您分享来自全球顶尖实验室的、参与系统研发和优化过程的早期用户,与大家分享他们的宝贵经验和研究成果。 (生物谷 bioon.com)

     
更多信息敬请关注:
富鲁达(上海)仪器科技有限公司
电话:021-32558368
邮箱:info-china@fluidigm.com
网址:cn.fluidigm.com

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