非编码RNA

缩写ncRNA,是指各种不翻译成蛋白质的RNA分子。其中包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA 和microRNA 等多种已知功能的 RNA,还包括未知功能的RNA。

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如何快速获得非编码RNA与疾病的最前沿资讯?

来源:生物谷 2017-10-12 13:58



非编码RNA是指不能翻译为蛋白的功能性RNA分子,占人类基因组的98%,之前被认为是没有功能的, 称为“垃圾RNA”, 或是叫“暗物质”。随着高通量测序技术, 基因芯片以及生物信息学的快速发展,这些大量的非编码RNA在人类生物学和疾病中发挥的作用被逐步揭示出来。其中具调控作用的非编码RNA主要包括miRNA、circRNA以及长链非编码RNA
近年来大量研究表明非编码RNA在人类疾病的调控中扮演了越来越重要的角色。包括肿瘤、神经系统疾病、心血管病的发生、以及参与免疫与代谢疾病调控、精子发育调控等,为开发疾病诊断标志物以及筛选新药靶标带来诸多新的方向。
去年3月在线发表在Cell期刊上的文章使人们的视线再度关注到环状RNA 研究,文章揭示了环状RNA也与蛋白一样受到癌症中基因组重排的影响,从而导致异常融合,促进肿瘤生长和发展。目前环状RNA已成为分子生物学领域的国际热点课题之一。
尽管如此,  依然还有很多未知的新的非编码RNA等待人类发现, 特别是揭示其生物学功能以及如何参与疾病调控的。在非编码RNA研究的技术层面也有一些新的方法出现。那么如何获取最新最前沿的资讯呢?
2017年10月27日到28日,生物谷将在上海好望角大酒店举办2017(第五届)非编码RNA研讨会,此次会议将继续围绕非编码RNA调控机理, 技术方法以及与疾病关系邀请国内外知名专家学者座谈,分享最新非编码RNA研究成果与经验,推动学科发展,促进转化医学及合作。
下面,小编给大家带来一些福利哦,既本次大会部分嘉宾的摘要分享,更多相关资讯可登陆会议官网:2017(第五届)非编码RNA研讨会

卜鹏程 研究员
中国科学院生物物理研究所

 卜鹏程,中国科学院生物物理研究所研究员,博士生导师。国家“青年千人计划”和中科院“百人计划” 入选者。2007年博士毕业于中国科学院生物物理研究所,获得中国科学院院长优秀奖、中国科学院优秀毕业生。博士期间,主要从事单克隆抗体治疗肿瘤血管生成机理的研究,研究成果荣获2014年北京市科学技术奖一等奖。2008-2010年在加州大学伯克利分校从事博士后研究,2010-2016年先后加入康奈尔大学和杜克大学任Research Associate和Senior Research Scientist。2016年加入中国科学院生物物理研究所任研究员,主要从事非编码RNA 与疾病以及肿瘤代谢方面的研究。近5年来在Cell Stem Cell、Nature Biotechnology, Nature Cell Biology,Nature Communications,Journal of Investigation、Cancer Research等国际期刊发表文章19篇,其中以第一作者和通讯作者在Cell Stem Cell发表研究论文2篇, Nature Communication 发表研究论文1篇,Molecular Systems Biology发表研究论文1篇, eLife 发表研究论文1篇。
演讲题目:非编码RNA对肠干细胞命运的调节及机制
干细胞可以进行不对称分裂,生成一个干细胞和一个分化的细胞。之前大家的研究集中理解蛋白质的不对称分布如何决定干细胞的命运, 我们近期的研究发现非编码RNA, miR-34a在肠癌干细胞分裂中不对称分布,调控干细胞的自我更新或分化。miR-34a在分化的细胞中高表达,干细胞中低表达。调节miR-34a的表达水平能够有效的调控肠癌干细胞的命运以及肠癌的发生和发展。miR-34a的不对称分布被一个长链非编码RNA, lnc34a调节。Lnc34a表达于miR-34a的启动子区,通过招募Dnmt3a和HDAC1抑制miR-34a在肠干细胞的表达。此外,miR-34a能够调控正常肠干细胞的不对称分裂。miR-34a介导的干细胞不对称分裂能够保护肠细胞在炎症条件下的恶性转化。炎症条件下,肠干细胞趋于快速扩增以修复炎症对上皮细胞的破坏。miR-34a介导的肠干细胞不对称分裂来控制干细胞有限扩增。miR-34a敲除后,肠干细胞转变为干细胞/干细胞对称分裂,干细胞趋于无限扩增并恶性转化。

郑晓飞 研究员
军事科学院军事医学研究院

军事科学院军事医学研究院放射与辐射医学研究所研究员,博士生导师,放射生物学北京市重点实验室副主任。主要从事非编码RNA结构与功能、肿瘤分子生物学和放射分子生物学研究,重点开展miRNA、tRNA半分子和lncRNA在肿瘤和细胞辐射损伤修复中的功能机制研究。至今在NAR、Hepatology、EMBO Rep等杂志发表SCI论文40余篇。发表的论文总被引用超过2200余次。目前担任中国生物化学与分子生物学会理事、核糖核酸专业委员会委员和中国生物化学与分子生物学报副主编等。
演讲题目:长链非编码RNA-SNHG1通过核质分布调控p53功能
长链非编码RNA(lncRNA)具有重要的生物学功能。lncRNA可以在不同层次调控基因表达。lncRNA在行使其调控功能时具备多种作用模式,lncRNA的表达水平、lncRNA与蛋白质分子的相互作用,以及lncRNA在细胞内的分布和亚细胞定位都影响不同lncRNA的功能。我们的研究首次证实lncRNA SNHG1通过竞争结合作用来调控蛋白-蛋白相互作用的新机制,揭示了阿霉素条件下SNHG1核质分布的改变以及SNHG1通过竞争结合hnRNPC削弱 hnRNPC同p53蛋白的相互作用进而增强p53蛋白稳定性的分子机制,以及促进p53依赖的细胞凋亡的生物学功能。上述研究结果揭示了长链非编码RNA在p53及其相互作用蛋白的调控网络中的重要作用。

胡继繁  教授,博士生导师
吉林大学第一医院肿瘤中心

胡继繁教授,博士,博士生导师,吉林大学唐敖庆特聘教授。分别在安徽医科大学、北京医科大学、美国康奈尔大学、美国斯坦福大学获学士、硕士、博士学位及进行博士后研究。 
胡继繁教授主要研究领域为肿瘤干细胞重编程和非编码RNA的表观遗传学分子调控。在Cell Stem Cell、Science、J Clin Invest、Genome Biology、Hepatology、Nucleic Acids Res、EMBO J、Biomaterials、Oncogene、J Cell Biol、JBC、MCB 等杂志发表原创性研究论文。在表观遗传学研究方面,重点探讨遗传基因印记机理、表观遗传基因修饰与肿瘤治疗。在转化医学应用方面研发肿瘤表观遗传学干细胞重编程。作为PI,曾主持美国国立健康研究所 (NIH)、美国国防部(DoD) 、美国加州再生医学研究所(CIRM)多项科研基金。回国任职后主持多项国家自然科学基金lncRNA重点和面上课题项目。
在非编码RNA领域,主要研究lncRNA对基因调控的表观遗传学机理、长链非编码RNA/染色质DNA结合、非编码RNA与染色质内环、lncRNA/DNA空间构象、非编码RNA三维基因调控方法。 
演讲题目: FLI1 exonic circular RNAs promote tumor metastasis by coordinately regulating TET1 and DNMT1
Friend leukemia virus integration 1 (FLI1), an ETS transcription factor family member, acts as an oncogenic driver in hematological malignancies as well as in solid tumors. Immunohistochemical staining shows that FLI1 is aberrantly overexpressed in advanced stage and metastatic cancers. However, little is known about the factors that activate this proto-oncogene in tumors. Using “chromatin-lncRNA in situ reverse transcription trap sequencing” (CLIST-Seq), we have identified two circular RNA in the FLI1 promoter chromatin complex, consisting of FLI1 exons 4-2-3 and exons 5-2-3-4, referred to as circFLI1s.
CircFLI1s are located both in the cytoplasm and in the nucleus. Silencing of circFLI1s, but not the FLI1 linear mRNA, significantly inhibits the migration of two highly aggressive SCLC cell lines (NCI-H446 and NCI-H1688). Overexpression of circFLI1s enhances invasiveness of cancer cells. In a xenograft tumor model, downregulation of circFLI1s prolongs tumor survival and reduces the metastasis of tumors to the lung and the liver. Notably, we demonstrate that the nuclear circFLI1s utilize a positive feedback mechanism to activate FLI1 by inducing DNA demethylation in CpG islands of the promoter. Mechanistically, circFLI1s bind to the FLI1 promoter in cis and recruit TET1, a demethylase that is actively involved in DNA demethylation. CircFLI1s also bind to and downregulate in trans DNMT1, a methyltransferase that is essential for the maintenance of DNA methylation. Thus, nuclear circFLI1s act as an upstream regulator to control tumor growth by coordinating the regulation of DNA methylating and demethylating enzymes.
The cytoplasmic circFLI1s, however, act as a molecular sponge to sequester and consequently inactivate tumor suppressor microRNA miR584-3p. Rho Associated Coiled-Coil Containing Protein Kinase 1 (ROCK1), a downstream target of the microRNA, is inactivated by circFLI1 knockdown, but is upregulated by ectopic expression of circFLI1s. Thus, both the cytoplasmic and nuclear circFLI1s utilize distinct mechanisms to promote tumor growth. Clearly, FLI1 drives tumor metastasis not only through the canonical oncoprotein pathway, but also using epigenetic mechanisms mediated by its exonic circular RNA.  

李家立 研究员 
中国科学院昆明动物研究所

李家立研究员, 男,博士,研究员,博士生导师,中科院昆明动物研究所表观遗传学与神经退行性疾病学科组负责人。2003年毕业于复旦大学上海医学院,获得神经生物学博士学位,后赴美国学习和工作,于2014年初入选中科院“引进国外杰出人才百人计划”,主要利用现代分子生物学和生物信息学方法手段,结合疾病动物模型, 研究和揭示了包括组蛋白翻译后修饰、DNA甲基化和去甲基化、以及非编码RNAs等表观遗传调控系统在大脑老化和神经退行性疾病中的作用和机理等方面研究。以第一和通讯作者,在《Nature Medicine》、《Nature Neuroscience》、《Genome Research》、《Brain》、《EMBO Reports》、《Current Biology》和《Journal of Neuroscience》等一系列国际期刊上,分别发表相关研究论文和综述10余篇。目前主持的项目包括科技部973子课题一项、国家自然科学基金面上项目和重大研究计划各一项;参与科技部重大研发计划一项。
演讲题目:Annotation and cluster analysis of spatiotemporal- and sex-related lncRNA expression in Rhesus Macaque brain
Long noncoding RNA (lncRNA)-mediated epigenetic regulation plays important roles in wide range of biological processes and diseases. Here, we applied comprehensive analyses of RNA-seq and CAGE-seq (cap analysis of gene expression and sequencing) to characterize dynamic changes in lncRNA expression in rhesus macaque brain in four age groups from postnatal to aged periods. We identified 18 anatomically diverse lncRNA modules and 14 mRNA modules representing spatial, age and sex specificities. Spatiotemporal- and sex-biased changes in lncRNA expression are in general higher than that observed in mRNA expression. A negative correlation between lncRNA and mRNA expression in cerebral cortex was observed, such relationship was further explored and functionally validated. Our findings offer an initial insight into spatial-, age- and sex-biased changes in lncRNA expression in macaque brain, and that the distinct classification of such changes might represent a previously unappreciated regulatory system which potentially contributes to postnatal brain development and ageing.

吴缅 教授
中国科学技术大学

博士生导师,中国科学院“百人计划”特聘教授;中国科学院天然免疫和慢性疾病重点实验室副主任。中国科大校学术委员会委员。主要从事肿瘤细胞生物学研究。1982年获南京师范大学生物学学士学位;1988年获美国哥伦比亚大学分子生物学博士;1989-1991在美国哈佛大学细胞与发育生物学系做博士后。1992开始任新加坡国立大学生物学系助理教授。2004-2006在新加坡南洋理工大学生物系任副教授。在生命科学领域的国际权威杂志包括:Nature Cell Biology,Molecular Cell, PNAS, EMBO J,Nature Communications等杂志上发表论文60多篇,被引用超过3000次。目前是Acta Biochimica et Biophysica Sinica、中国生物化学与分子生物学报编委并担任Journal of Molecular and Cell Biology副主编。
演讲题目:一石二鸟: 长非编码RNA参与DNA损伤修复的新机制
The DNA damage response (DDR) involves a complicated network that detects and repairs DNA lesions to support cell survival, whether the long non-coding RNAs also play important roles in this process has not been extensively studied. Here we demonstrate that lincRNA-H6, a novel p53 responsive transcript, maintains the integrity of the genome stability through its dual functions. Our results show that on one hand, lincRNA-H6 acts as sponge to increase the level of TRF2 (telomeric repeat binding factor 2), which protects telomeres from being recognized as DNA breaks. On the other hand, lincRNA-H6 sustains the stability of BRCA1. Together, these results indicate lincRNA-H6 may play a dual function in DNA damage response.
以下是本次会议的日程


生物谷将在2017(第五届)非编码RNA研讨会现场举办五周年嘉年华活动,所有参会代表均可向本次会议的学术委员会投稿你最喜欢的论文摘要,活动现场会将经大会学术委员会审核通过的投稿文章在论文墙中展示出来供大家投票,票数最多的将获得本次会议最具人气奖,获奖者将获得iPad一台。另外投稿参与既有机会获得500元生物谷会议代金卷等精美礼品。欢迎大家积极投稿参与!
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