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Mol Cell:揭示miR-122抵抗肝细胞癌机制

来源:本站原创 2017-07-22 20:53


图片来自Molecular Cell, doi: 10.1016/j.molcel.2017.06.025

2017年7月22日/生物谷BIOON/---一种被称作microRNA-122(miR-122)的微RNA(microRNA, miRNA)仅在肝脏中产生。在肝脏中,它调节着很多基因的活性,发挥着抑制肿瘤的功能,然而迄今为止,人们还没有完整地对miR-122靶基因网络进行系统性阐明和直接的生化阐明。

为此,在一项新的研究中,来自美国洛克菲勒大学、俄亥俄州立大学和芝加哥大学的研究人员揭示了这种miR-122可能阻止正常的肝细胞变成恶性肿瘤细胞的一种机制。相关研究结果于2017年7月20日在线发表在Molecular Cell期刊上,论文标题为“Argonaute CLIP Defines a Deregulated miR-122-Bound Transcriptome that Correlates with Patient Survival in Human Liver Cancer”。论文通信作者为俄亥俄州立大学综合癌症中心病理学系研究员Kalpana Ghoshal和洛克菲勒大学霍华德-休斯医学研究所分子神经肿瘤学实验室研究员Robert B. Darnell。

Darnell和论文第一作者、作为一名研究生在Charles M. Rice实验室接受培训的博士后研究员Joseph Luna利用Darnell实验室开发一种被称作Argonaute蛋白交联免疫沉淀(Argonaute crosslinking immunoprecipitation, Ago-CLIP)测序的技术在miR-122基因敲除小鼠肝脏和对照小鼠肝脏中鉴定出miR-122调节的11000个基因。除此之外,他们利用这种技术在匹配的人肝细胞癌(HCC)和良性肝脏组织中在全转录组范围内鉴定出miR-122结合的靶基因位点。他们观察到绝大多数miR-122结合到靶基因的3’-非翻译区(3’-UTR)和编码外显子上,随后广泛地结合到其他的基因位点和非基因位点上,而且对miR-122依赖性结合的基序分析揭示出除典型基序之外的一种G凸出的基序。此外,他们还发现miR-122的大多数靶基因是物种特异性的。

通过与来自俄亥俄州立大学的同事们合作,Darnell团队随后特别关注与一个常见的肝癌(即肝细胞癌)相关联的靶基因BCL9,研究了当miR-122不存在时,BCL9激活的信号通路。上调表达几种小鼠靶基因和人靶基因,特别是BCL9,可预测HCC患者的存活率。这些结果广泛地确定了HCC中的miR-122下调表达的分子结果。

这些研究人员说,他们的发现可能加快开发新的药物靶标和预测工具。(生物谷 Bioon.com)

参考资料:

Joseph M. Luna, Juan M. Barajas, Kun-yu Teng et al. Argonaute CLIP Defines a Deregulated miR-122-Bound Transcriptome that Correlates with Patient Survival in Human Liver Cancer. Molecular Cell, Published: July 20, 2017, doi:10.1016/j.molcel.2017.06.025

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