打开APP

Cell Stem cell:北京大学邓宏魁化学诱导重编程领域又一重大发现

  1. 干细胞

来源:生物谷 2017-07-04 10:15

作为利用化学小分子诱导体细胞向可诱导多能干细胞重编程领域的著名学者,北京大学邓宏魁教授及其团队近期又建立了一套完整可靠的小分子重编程方法[1]。令人惊奇的是,在体细胞经化学小分子重编程为诱导多能干细胞的过程中,细胞会经历一种胚外内胚层样细胞(Extra-Embryonic Endoderm-like state, XEN-like state)中间状态[2],通过对这一中间状态细胞的详细

作为利用化学小分子诱导体细胞向可诱导多能干细胞重编程领域的著名学者,北京大学邓宏魁教授及其团队近期又建立了一套完整可靠的小分子重编程方法[1]。令人惊奇的是,在体细胞经化学小分子重编程为诱导多能干细胞的过程中,细胞会经历一种胚外内胚层样细胞(Extra-Embryonic Endoderm-like state, XEN-like state)中间状态[2],通过对这一中间状态细胞的详细研究发现,胚外内胚层样细胞能够像多能干细胞一样分化成部分体细胞,如功能性神经元及肝脏细胞,也有望分化产生更多类型的体细胞,如此一来,在不经历多能态(pluripotent state)下,从单一体细胞向多种体细胞的分化便成了现实。更难能可贵的是,胚外内胚层样细胞在特定培养条件下能够实现细胞命运的维持,在多次传代后(大于20代),依然能稳定地保持胚外内胚层样细胞主导基因(Sox17,Gata4,Gata6,Sall4)的表达和基因组稳定性,同时能够像低代次胚外内胚层样细胞一样分化成为功能性神经元及肝脏细胞,因此以胚外内胚层样细胞为平台,能够实现细胞的大规模扩增,为临床及科研供给不同类型的体细胞。 

背景介绍

如何在体外获得具有生理功能的体细胞对于再生医学而言是个重要问题,近年来细胞系的重编程让问题的解决看到了希望。化学介导的重编程更是获得了众多研究资源的青睐[3-5]。相比于传统转基因方法介导的重编程,化学方法解决了内源基因的修改所导致的潜在致突变及致癌风险,同时化学小分子兼具了细胞膜穿透性、可逆性、可控性和易于制造等诸多优点。

邓宏魁教授课题组在近期获得了鼠源体细胞向干细胞状态化学重编程的稳定方法,该方法的第一阶段是将鼠源体细胞重编程为独特的上皮型胚外内胚层样细胞(epithelial XEN-like state),第二阶段是进一步重编程为限定型胚外内胚层样细胞(defined XEN-like state),因此研究人员可在第二阶段稳定地获取胚外内胚层样细胞。 

在这项研究中,研究人员试图绕过干细胞阶段,通过胚外内胚层样细胞产生特定功能的体细胞。通过对重编程小分子化合物组合的微调,获得了稳定的神经元诱导方法。参照肝脏细胞诱导方法,肝脏细胞也能通过胚外内胚层样细胞诱导产生。研究人员同时实现了胚外内胚层样细胞命运的维持,在长时间培养及多次传代的基础上,保持了相关基因的稳定表达、细胞基因组的稳定性及分化可塑性,实现了胚外内胚层样细胞的规模化量产。 

结果

化合物的微调以获得稳定的胚外内胚层样细胞

根据已经发表的文献,胚外内胚层样细胞的原始克隆可在重编程的早期阶段通过引入7种小分子化合物(VPA,CHIR99021,616452,tranylcypromine,forskolin,AM580,and EPZ004777;即VC6TFAE)获得。TD114-2和CHIR99021均为GSK3-β抑制剂,然而TD114-2已被证明具有更强的作用[6],在该实验中,研究人员将CHIR99021替换为TD114-2后发现胚外内胚层样细胞的原始克隆提高了3倍,但胚外内胚层样细胞的主导基因(Sox17,Gata4,Gata6,Sall4)的表达并未受到影响(图1 A-C),因此通过对化合物的微调,显著地提高了从体细胞到胚外内胚层样细胞的重编程效率。


图1 化学诱导神经元的分化策略
A.胚外内胚层样细胞的相衬图像和原始克隆的诱导效率(经TD114-2 组合或 CHIR 组合);
B.胚外内胚层样细胞主导基因(Sox17,Gata4,Gata6,Sall4)的定量PCR分析(经TD114-2组合或 CHIR 组合);
C.经TD114-2组合诱导产生的原始克隆的免疫染色分析;
D.胚外内胚层样细胞重编程及神经元分化示意图;
E.不同初始细胞密度下,Tau-EGFP阳性细胞的诱导效率(经TD114-2组合或 CHIR 组合);
F.Tau-EGFP阳性细胞在进一步诱导前后的对比图;
G.成纤维细胞、Tau-EGFP阳性细胞和初级神经元的聚类分析;
H.成纤维细胞、Tau-EGFP阳性细胞和初级神经元的基因表达热图. 

由胚外内胚层样细胞稳定地产生神经元样细胞

Tau蛋白的表达可以作为神经元生成的标志,因此研究人员制备了Tau-EGFP细胞系来实时监测神经元样细胞的产生。研究人员综合概括了不同的诱导生成神经元的实验方案,确定了Forskolin,CHIR99021及Dorsomorphin(FCD)联用的实验思路(图1D),发现最早可于诱导的第4天出现Tau-EGFP阳性细胞,在诱导的第8-12天Tau-EGFP阳性细胞可占比50%以上,继续延长神经元诱导时间发现Tau-EGFP阳性细胞延伸出了轴突样分枝,这一现象标志着神经元的逐渐成熟(图1 F)。且通过对成纤维细胞、Tau-EGFP阳性细胞及初级神经元阳性对照的转录组测序(RNA-seq)分析表明,Tau-EGFP阳性细胞的基因表达已经完全不同于成纤维细胞,但和神经元阳性对照极其相似(图1H)。以上结果证明,神经元样细胞能够通过胚外内胚层样细胞诱导分化产生。

诱导产生的神经元样细胞在基因表达上和初级神经元相似

为进一步探究这些诱导产生的神经元样细胞(Tau-EGFP阳性细胞)的基因表达特征,研究人员检测了典型的泛神经元标志物的表达,共免疫染色结果显示,Tau-EGFP阳性细胞同时表达了包括TUJ1, MAP2, NF-H 在内的轴突生长共表达神经特异性蛋白(extensive neurite growth co-expressed multiple neuronal-specific proteins)(图2A-E)。进一步实验发现,当延长神经元诱导时间至18天,Tau-EGFP阳性细胞会共表达vGLUT1蛋白(效率为80%),共表达GABA蛋白(效率为5%),因此可以证明Tau-EGFP阳性细胞会进一步成熟为兴奋性谷氨酸能神经元和抑制性GABA能神经元(图2F-G)。 

诱导产生的神经元样细胞的成熟及功能特性

为探究诱导产生的神经元的电生理特性,研究人员采用了全细胞膜片钳技术(whole-cell patch-clamp),在电流钳模式中,通过对细胞膜进行除极,12+12天诱导产生的Tau-EGFP阳性神经元产生了动作电位。在电压钳模式中,伴随着电压依赖性的钠、钾通道的开启,Tau-EGFP阳性神经元产生了快速内向及外向的电流。以上实验证明,胚外内胚层样细胞可被诱导成为功能性神经元细胞。 

为进一步促进诱导产生的神经元样细胞的成熟,研究人员采用了与星形胶质细胞共培养的策略[7],共培养后的神经元样细胞展现了更为复杂的神经元形态,同时细胞膜电生理特性被进一步提升(图2I-K),而且自发性兴奋性突触后电流(EPSCs)也能被检测到。令人激动的是,80%的Tau-EGFP阳性神经元同时表达了成熟神经元标志蛋白NEUN(图2H)。此外,诱导产生的神经元的功能亚型也能被聚焦应用100mM谷氨酸引起的内向电流所确证(图2M)。


图2诱导产生神经元的特征分析
A-E.Tau-EGFP阳性神经元共表达泛神经元标志物 [TUJ1 (B),NF-H (C),MAP2 (D) 和SYN (E)];
F-H.Tau-EGFP阳性神经元共表达神经元功能亚型及成熟标志物 [vGLUT1 (F),GABA (G) 和 NEUN (H)];
I.Tau-EGFP阳性神经元与星形胶质细胞共培养后的膜片钳记录;
J.Tau-EGFP阳性神经元动作电位的发放;
K.电压膜片钳记录了细胞的内向电流,且该电流可被河豚毒素所阻断;
L.Tau-EGFP阳性神经元与星形胶质细胞共培养后可出现自发性兴奋性突触后电流;
M.焦点应用100mM谷氨酸触发内向膜电流;
N.将Tau-EGFP阳性神经元向小鼠脑内移植的示意图;
O-Q.移植后的Tau-EGFP阳性神经元能够存活并逐渐成熟,均为单核细胞,且能检测到动作电位的发放.

移植入成年鼠大脑中诱导产生的神经元样细胞的存活与成熟

为探究诱导产生的神经元的在体功能,研究人员将Tau-EGFP阳性神经元移植到成年小鼠(大于8周)的纹状体中,移植4周后观察发现,在注射部位能够清晰地看到Tau-EGFP阳性神经元(图2N,O)。为进一步证明移植的细胞为外源性,研究人员通过对单一细胞中细胞核计数的方法研究了细胞与细胞融合的可能性[8],结果显示移植的Tau-EGFP阳性神经元均为单一细胞,均为单核形式且具有电生理功能(图2P-Q)。综上所述,经胚外内胚层样细胞诱导产生的神经元在体内同样具有生理活性。 

长期扩增的胚外内胚层样细胞维持了基因组稳定性和神经元分化潜能

为进一步研究胚外内胚层样细胞的特性,研究人员研究了胚外内胚层样细胞的生长速率,发现其生长速率(约20小时细胞数量翻倍)比原始成纤维细胞的生长速率(约40小时细胞数量翻倍)快,但慢于胚胎干细胞(约15小时细胞数量翻倍)(图3A)。经以TD114-2为基础重编程产生的胚外内胚层样细胞能够扩增至少20代(每3-4天传代一次,消化成单细胞,以1:20-30比例传代)(图3B-C)。尽管胚外内胚层样细胞具有高度可扩增性,但该类细胞注入免疫缺陷小鼠(SCID)体内后证明其不具成瘤性。通过核型分析及基因组杂交分析表明,长期扩增的胚外内胚层样细胞保持了基因组的完整性及稳定性,更为重要的是,保持了胚外内胚层样细胞主导基因的表达及神经元分化潜能(图3C-L)。 

由胚外内胚层样细胞诱导产生肝脏细胞样细胞

前期胚外内胚层样细胞的分化方向主要集中于神经细胞(外胚层系细胞),那么胚外内胚层样细胞的分化可塑性是否仅局限于外胚层系细胞仍需进一步实验证明。研究人员参考并改进了前人所用的肝脏细胞诱导方法[9],发现无论是低代次还是高代次的胚外内胚层样细胞均能在20天的诱导条件下产生肝脏细胞的典型形态。进一步研究证明,这些肝脏细胞样细胞能够表达细胞色素P450酶系,且免疫染色证明呈甲胎蛋白(AFP)及白蛋白(albumin)阳性。从功能水平而言,这些诱导产生的肝脏细胞样细胞亦能有效分泌白蛋白及尿素。综上,胚外内胚层样细胞亦可分化成为肝脏细胞样细胞(内胚层系细胞),证明了胚外内胚层样细胞的可塑性强。


图3 长期扩增的胚外内胚层样细胞保持了基因组稳定性和分化潜能
A.成纤维细胞、胚胎干细胞及胚外内胚层样细胞的细胞数量翻倍所用时间;
B.2代及20代的胚外内胚层样细胞的相衬图像;
C.20代的胚外内胚层样细胞共表达胚外内胚层样细胞主导基因(Sox17,Gata4,Gata6,Sall4);
D.胚外内胚层样细胞的核型分析;
E.不同代次的胚外内胚层样细胞的染色体数目的分布,n代表供检测的细胞数;
F.胚外内胚层样细胞的基因组杂交分析;
G.成纤维细胞与胚外内胚层样细胞的全基因组表达热图;
H-I.由高代次胚外内胚层样细胞诱导产生的Tau-EGFP阳性神经元表达了典型的神经元标志物,且具有电生理活性;
J.不同代次的胚外内胚层样细胞诱导产生的Tau-EGFP阳性神经元的分化效率;
K.不同代次的胚外内胚层样细胞、初级神经元、脑细胞、成纤维细胞的聚类分析;
L.规模化扩增胚外内胚层样细胞的示意图. 

研究意义

该项研究成功实现了由单一体细胞经重编程后分化为多种体细胞的重大突破,而不经干细胞阶段。在其中扮演中枢角色的胚外内胚层样细胞不仅具有良好的可塑性、安全性,更能够实现胚外内胚层样细胞快速而持续的扩增和命运的维持。在干细胞领域,干细胞与祖细胞“干性”的维持一直以来都是一个难点,这项工作要求研究人员既要保证可塑性细胞的快速生长以满足未来的强大的临床需求,也要保证可塑性细胞不向下游分化。为达到这个目的,研究人员需要修改或微调培养基组成,尝试各种培养条件,需要付出大量的时间和精力。在该项研究中,邓宏魁教授课题组成功实现了胚外内胚层样细胞快速扩增与命运维持,这项研究无论是对于干细胞科研领域还是再生医学治疗领域的意义都是深远而重大的。 

参考文献

[1] Hou, P., Li, Y., Zhang, X.,Liu, C., Guan, J., Li, H., Zhao, T., Ye, J., Yang, W., Liu, K., et al. (2013).Pluripotent stem cells induced from mouse somatic cells by small-molecule
compounds. Science 341, 651–654;
[2] Zhao, Y., Zhao, T., Guan, J.,Zhang, X., Fu, Y., Ye, J., Zhu, J., Meng, G., Ge, J., Yang, S., et al. (2015).A XEN-like state bridges somatic cells to pluripotency during chemical
reprogramming. Cell 163, 1678–1691;
[3] Xu, J., Du, Y., and Deng, H.(2015). Direct lineage reprogramming: strategies, mechanisms, and applications.Cell Stem Cell 16, 119–134;
[4] Zhang, L., Yin, J.C., Yeh,H., Ma, N.X., Lee, G., Chen, X.A., Wang, Y., Lin, L., Chen, L., Jin, P., et al.(2015). Small molecules efficiently reprogram human astroglial cells into
functional neurons. Cell Stem Cell 17, 735–747;
[5] Cao, N., Huang, Y., Zheng,J., Spencer, C.I., Zhang, Y., Fu, J.D., Nie, B., Xie, M., Zhang, M., Wang, H.,et al. (2016). Conversion of human fibroblasts into functional cardiomyocytes
by small molecules. Science 352, 1216–1220;
[6] Storm, M.P., Bone, H.K.,Beck, C.G., Bourillot, P.Y., Schreiber, V., Damiano, T., Nelson, A., Savatier,P., and Welham, M.J. (2007). Regulation of Nanog expression by phosphoinositide
3-kinase-dependent signaling in murine embryonic stem cells. J. Biol. Chem.
282, 6265–6273;
[7] Vierbuchen, T., Ostermeier,A., Pang, Z.P., Kokubu, Y., S€udhof, T.C., and Wernig, M. (2010). Directconversion of fibroblasts to functional neurons by defined factors. Nature 463,
1035–1041;
[8] Alvarez-Dolado, M., Pardal,R., Garcia-Verdugo, J.M., Fike, J.R., Lee, H.O., Pfeffer, K., Lois, C.,Morrison, S.J., and Alvarez-Buylla, A. (2003). Fusion of bone-marrow-derived
cells with Purkinje neurons, cardiomyocytes and hepatocytes. Nature 425,968–973;
[9] Cai, J., Zhao, Y., Liu, Y.,Ye, F., Song, Z., Qin, H., Meng, S., Chen, Y., Zhou, R., Song, X., et al.(2007). Directed differentiation of human embryonic stem cells into functional
hepatic cells. Hepatology 45, 1229–1239.

版权声明 本网站所有注明“来源:生物谷”或“来源:bioon”的文字、图片和音视频资料,版权均属于生物谷网站所有。非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,否则将追究法律责任。取得书面授权转载时,须注明“来源:生物谷”。其它来源的文章系转载文章,本网所有转载文章系出于传递更多信息之目的,转载内容不代表本站立场。不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。

87%用户都在用生物谷APP 随时阅读、评论、分享交流 请扫描二维码下载->