Cell：科学家发现新型基因突变 为癌症诊断和治疗提供思路

2017年2月27日讯 /生物谷BIOON/ --威尔康奈尔医学院和纽约基因组中心的一项最新研究在癌细胞内发现了一种新的基因突变类型，或为了解癌症起源提供线索，同时也为开发新的治疗方法提供靶点。

借助下一代基因测序技术，科学家们已经知道癌症的根源在于破坏蛋白质序列的突变。突变会导致细胞合成异常活跃或发生功能紊乱的蛋白，也会导致细胞无法合成一些蛋白，最终导致癌症的发生。在最近发表在Cell上的这项研究中，研究人员介绍了一种可能导致癌症发生的新型突变：在基因组的非编码区域发生微小DNA序列（1到50个碱基）的插入或缺失，也叫做“indels”。

“这些非编码区域也有重要作用，因为它们包含了一些能够影响基因调控的序列。我们已经知道这些区域有非常重要的生物学意义，问题在于这些区域如何影响癌症发育。”文章作者Dr. Marcin Imielinski教授这样说道。

在这项研究中，研究人员对几个公共数据库中肿瘤样本的基因序列信息进行了分析，着重研究基因组中占98%的非蛋白编码区域。他们从肺腺癌这种最常见的肺癌开始，发现这些样本的基因组中最常见的indel突变区域位于编码表面活性蛋白的基因中。

之前没有研究将这些对健康肺功能非常重要的基因与肺癌联系在一起。但是它们在发展为肺腺癌的细胞类型中存在高水平特异性的表达。

研究人员还对12种其他类型癌症的基因组进行分析，发现在肝脏、胃和甲状腺肿瘤中存在类似的模式。

“在每一种癌症中，非编码的indel突变都会聚集在对器官功能非常重要的基因上，但是这些基因之前都未与癌症联系在一起。”Imielinski教授表示。这些非编码的indel突变非常常见，20%~50%的相关癌症中都存在这种突变。

“这种突变发生的频率与最著名的致癌突变一样高，任何基因或序列以这种频率发生突变都可能导致癌症发生。如果我们可以证明这一点，那将会是令人感到非常兴奋的结果。”

“这些突变可以用作生物标志物帮助我们进行癌症的早期诊断，或者当存在转移灶无法定位原发灶的时候可以用于指示原发灶。这项研究的发现可以有许多可能的临床应用。”（生物谷Bioon.com）

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原始出处：

Marcin Imielinski et al. Insertions and Deletions Target Lineage-Defining Genes in Human Cancers, Cell (2017).