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PLoS Comput Biol:病人和HIV遗传差异共同决定着HIV的感染进展

来源:生物谷 2017-02-11 20:53


2017年2月11日/生物谷BIOON/---根据一项新的研究,在HIV感染者之间观察到的疾病进展率差异当中,大约三分之一的差异是由HIV遗传差异和病人遗传差异一起导致的。这些发现提示着病人遗传差异通过触发HIV病毒基因组发生突变而影响疾病进展。相关研究结果于2017年2月9日发表在PLoS Computational Biology期刊上,论文标题为“Estimating the Respective Contributions of Human and Viral Genetic Variation to HIV Control”。

HIV感染者经历着不同的疾病进展率。在具有更高病毒载量的HIV感染者体内,HIV进展得更快。HIV病毒载量指的是在一名感染者的血液中发现的HIV病毒遗传物质数量。

之前的研究已证实HIV感染者的遗传差异和他们体内的特定HIV毒株遗传差异共同影响着HIV病毒载量。如今,作为首批科学家,瑞士洛桑联邦理工学院(école Polytechnique Fédérale de Lausanne)的István Bartha和同事们研究了病人遗传差异和病毒遗传差异对同一群HIV感染者血液中HIV病毒载量的相对影响。

这些研究人员收集了541名HIV感染者的病人遗传数据和病毒遗传数据。他们利用一种被称作线性混合建模(linear mixed modeling)的计算建模方法确定病人遗传差异和病毒遗传差异如何可能解释这些病人之间的病毒载量差异。

他们发现HIV病毒毒株之间的遗传差异解释了这些病人之间29%的病毒载量差异,而病人遗传差异解释了其中的8.4%的病毒载量差异。归纳在一起,这两种遗传差异刚好解释了30%的病毒载量差异,这表明病人遗传差异通过诱导HIV病毒在病人体内增殖时发生基因突变而发挥它的大多数影响。

论文通信作者Jacques Fellay说,“我们的论文证实病人和感染性病毒的遗传组成导致HIV的临床感染进展。”

为了证实和优化这些发现,还需针对更大的HIV感染病人群体进一步开展研究。

Fellay说,不论如何,“将宿主数据和病原体数据结合在一起让我们对控制HIV的遗传决定因子产生新的认识。一种类似的策略可能被用来更好地理解其他的慢性传染病。”(生物谷 Bioon.com)

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原始出处:

István Bartha, Paul J. McLaren, Chanson Brumme et al. Estimating the Respective Contributions of Human and Viral Genetic Variation to HIV Control. PLoS Computational Biology, Published: February 9, 2017, doi:10.1371/journal.pcbi.1005339.

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