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Nature:鉴定出宫颈癌的新的基因组特征

来源:生物谷 2017-01-25 22:31


2017年1月25日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自癌症基因组图谱研究网络(The Cancer Genome Atlas Research Network, TCGA)的研究人员鉴定出宫颈癌的新的基因组特征和分子特征。这将有助于对这种疾病进行分型,并且可能有助开发出最适合每名宫颈癌病人的靶向疗法。他们对178种原发性宫颈癌的基因组进行完整的分析,结果发现70%以上的宫颈瘤在一到两种重要的细胞信号通路中发生基因组变化。令人意外的是,他们也发现一小部分宫颈瘤并不表现出人乳头瘤病毒(HPV)感染的证据。相关研究结果于2017年1月23日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Integrated genomic and molecular characterization of cervical cancer”。

在全世界,每年有50多万新发宫颈癌病例和25多万宫颈癌死亡病例。美国国家癌症研究所代理主任Douglas Lowy博士说,“绝大多数宫颈癌病例是由致癌性HPV持续感染所导致的。多年来,已有有效地抵抗大多数致癌性HPV类型的预防性疫苗面世,接种它们有长期的潜力来降低宫颈癌病例数量。”

Lowy博士注意到,“然而,大多数在未来的几十年内患上宫颈癌的女性已超过推荐进行接种疫苗的年龄,因而将不会获得这种疫苗的保护。因此,宫颈癌仍然是一种急需有效疗法的疾病,而且除了HPV的基因之外,这项最新的TCGA分析可能有助在发现靶向宫颈癌基因组的重要序列元件的药物中取得突破性进展。”

这项研究的一个特别令人关注的方面是鉴定出一组独特的8种宫颈癌与子宫内膜癌存在分子类似性。这些子宫内膜样肿瘤(endometrial-like tumor)主要是HPV阴性的,而且它们都在KRAS、ARID1A和PTEN基因上发生较高频率的突变。

美国国家癌症研究所TCGA项目办公室主任Jean-Claude Zenklusen博士注意到,“鉴定出HPV阴性子宫内膜样肿瘤证实并不是所有的宫颈癌都与HPV感染存在关联,而且严格来说,一小部分宫颈癌可能是由遗传因子或其他因子导致的。” TCGA项目在过去的十年里已研究了30多种肿瘤类型。

鉴于免疫疗法在癌症治疗中正变得越来越重要,研究人员研究了编码已知的免疫靶标的基因以便观察其中的任何一种基因是否发生扩增,这种基因扩增可能预测病人对免疫疗法作出的反应性。他们发现几种这样的基因发生扩增,特别是CD274基因(编码免疫关卡蛋白PD-L1)和PDCD1LG2基因(编码免疫关卡蛋白PD-L2)。已经证实几种关卡抑制剂是有效的免疫治疗试剂。此外,这项TCGA分析鉴定出几种新的突变基因(包括MED1、ERBB3、CASP8、HLA-A和TGFBR2)存在于宫颈癌中。他们也鉴定出几种宫颈癌病例存在涉及BCAR4的基因融合。基因BCAR4产生一种长链非编码RNA(lncRNA),而这种lncRNA已经证实诱导对拉帕替尼---抑制乳腺癌中一种关键通路的口服药物---产生反应性。因此BCAR4可能是携带这种变化的宫颈癌的潜在治疗靶标。

鉴于免疫疗法在癌症治疗中正变得越来越重要,研究人员研究了编码已知的免疫靶标的基因以便观察其中的任何一种基因是否发生扩增,这种基因扩增可能预测病人对免疫疗法作出的反应性。他们发现几种这样的基因发生扩增,特别是CD274基因(编码免疫关卡蛋白PD-L1)和PDCD1LG2基因(编码免疫关卡蛋白PD-L2)。已经证实几种关卡抑制剂是有效的免疫治疗试剂。此外,这项TCGA分析鉴定出几种新的突变基因(包括MED1、ERBB3、CASP8、HLA-A和TGFBR2)存在于宫颈癌中。他们也鉴定出几种宫颈癌病例存在涉及BCAR4的基因融合。基因BCAR4产生一种长链非编码RNA(lncRNA),而这种lncRNA已经证实诱导对拉帕替尼---抑制乳腺癌中一种关键通路的口服药物---产生反应性。因此BCAR4可能是携带这种变化的宫颈癌的潜在治疗靶标。

当分析宫颈瘤中这些分子变化背后的生物学特征时,研究人员发现将近四分之三的宫颈癌在PI3K/MAPK信号通路和/或TGFβ信号通路中发生基因组变化,这可能也提供治疗靶标。他们注意到这项研究提出的一个重要问题是HPV阳性宫颈瘤或HPV阴性宫颈瘤是否会对靶向疗法作出不同的反应。(生物谷 Bioon.com)

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Integrated genomic and molecular characterization of cervical cancer

The Cancer Genome Atlas Research Network

doi: 10.1038/nature21386

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