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深圳国家基因库正式运营,提供顶尖生物信息数据和样本平台

来源:生物谷 2016-09-22 22:37

深圳国家基因库开业仪式

深圳国家基因库开业仪式于2016年9月22日隆重举行。国家基因库理事会成员单位、科学委员会专家学者、全球知名合作伙伴代表及生物谷等媒体代表应邀出席了仪式。

深圳国家基因库于2011年1月获得国家发改委批复,依托深圳华大基因研究院组建,是我国唯一一个获批筹建的国家基因库。

国家基因库由基因信息数据库和生物样本资源库组成。据国家基因库执行主任徐讯介绍,此次宣布启动的国家基因库数字化平台,装备了150台BGISEQ-500型测序仪和1台RevolocityTM测序仪,目前总数据产量将达到每年5Pb,相当于一年5万人全基因组或是1000万产前筛查的数据产出规模,升级后的系统预计年产数据可达10Pb,将成为全球最大的数据产出平台。同时,宣布启动的国家基因库开放数据中心,已经建成了20Pb数据的可访问能力,并规划在二期完成500Pb的可访问能力,能力上超越国际三大基因数据中心,填补了我国长期缺少国家级基因数据中心的空白。该数据中心首批将对公众开放1Pb的非冗余数据的检索和比对服务,涵盖罕见病、癌症、肠道菌群、农业、物种多样性等13个高质量的数据库,将大大促进全球生命科学领域的进步,在疾病诊断和治疗、农业新资源的开发和利用、物种和生态多样性保护等基因相关产业的发展中也将起到重要的推动作用。

深圳国家基因库

此外,深圳国家基因库也是世界上最大的基因库。在世界范围内,之前最大的是美国的NCBI,欧洲有EBI,日本有DDBJ,但在国家基因库正式投入使用后,吞吐量将达到美国的NCBI同等规模,不过考虑到国家基因库兼具的数据库、干库和湿库样品库,以及活体库等,国家基因库将成为全球第一家综合性基因库,并且从样品保存的规模、存储量和可访问的数据量来看也将是全球最大的。

深圳国家基因库初步建成"三库两平台"的业务结构和功能,"三库"由生物资源样本库、生物信息数据库和生物活题库组成,"两平台"为数字化平台、合成与基因编辑平台。国家基因库将搭建起基因资源挖掘的基础性支撑及公共服务平台,促进基因组学在精准农业、海洋开发、微生物应用等方面的前沿探索与产业转化,催生新技术、新产品和新模式,形成从资源到科研再到产业的全贯穿,全覆盖模式。

深圳国家基因库主任梅永红

目前,基因库与联合国粮食及农业组织(FAO)、国际农业研究磋商组织(CGIAR)、国际生物和环境样本库(ISBER)、全球生物多样性联盟(GGBN)、挪威世界末日种子库、中国科学院海洋研究所、北京重大疾病临床数据和样本资源库、深圳超算中心等100多家国内外科研机构、行业组织建立了合作关系,在人类健康、生物多样性、生物进化机制等方面开展了合作研究。

深圳国家基因库主任梅永红表示,此次开业仪式是深圳国家基因库发展的一个里程碑,国家基因库将继续以服务国家战略需求作为出发点,融合近年来生命科学学科的国际前沿动向,进一步完善 "三库两平台"的业务结构,扮演好公共服务平台的角色,形成从资源到科研、产业的全贯穿全覆盖的模式,实现大资源、大数据、大科学、大产业的联动。(生物谷Bioon.com)

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