微生物组

从人体微生物组计划(2007年)到国家微生物组计划(2016年),美国酝酿了十年,各国也对微生物组研究投入了大量努力。微生物组学研究发展非常快,肠道微生物组与人体的多种疾病相关联,深刻影响了疾病的治疗和临床研究,包括体重、糖尿病、免疫系统、肠道疾病、代谢疾病、炎症、心脏病、大脑神经系统等等,被认为是人体的“第二基因库”。

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Science:科学家发现控制肠道菌群健康的69种因子

来源:生物谷 2016-05-04 23:54

图片来源:www.sciencealert.com

2016年5月4日 讯 /生物谷BIOON/ --在我们肠道深处存在着非常繁荣昌盛的一种微型生态系统,这就是肠道微生物组(肠道菌群),肠道菌群的微妙平衡对于维持机体健康和消化系统的功能非常重要;如今来自比利时的研究人员通过对从巧克力到避孕药的多种和人类息息相关的产品进行筛查,鉴别出了69种不同的因子可以影响机体肠道微生物组的组成,相关研究刊登于国际杂志Science上。

提及影响肠道菌群的平衡,我们首先想到的是摄入的食物,其实并不总是摄入的食物,睡眠、习惯以及生活方式对肠道菌群的平衡都有着巨大的影响;研究者希望本文研究为更好地理解肠道菌群的平衡机制提供新的线索,同时也可以帮助揭示肠道菌群如何维持健康以及有效抵御机体疾病的机制。

正如研究者Jessica Hamzelou在New Scientist(《新科学人》)上报道说,一些研究结果认为,我们摄入的水果和纤维的量对机体肠道的健康有着明显的影响,而其它因子目前研究者还并不确定,比如是否摄入牛奶、白巧克力或者激素避孕药等等。同时研究者还指出,抗炎性药物、摄入酒精的水平都会改变肠道菌群的平衡,实际上具有较强影响作用的因子往往和个体的肠道运动的方式和一致性有一定关系。

本文研究中,研究人员对1100名志愿者进行分析,调查了志愿者的饮食、生活方式、习惯,同时对他们进行血液检测,进行这项大型研究可以帮助研究人员深入理解机体肠道系统的工作原理,当然如今研究者并不是很清楚是什么造就了机体健康的肠道微生物组,而且也并不知道什么样的因子会引发严重的疾病,比如癌症等。我们的肠道菌群和心理健康和其它状况比如肥胖也存在一定关联。

研究者指出,所有的69种因子仅占到了肠道微生物组改变的7%,研究者认为这些遗传特性或许扮演着重要的角色,Raes说道,细菌或许有可能会通过自身的方式来不断改变小生境的功能;而对肠道菌群的深入分析对于开发基于肠道细菌的诊断技术和新型药物非常关键,当然我们还需要理解肠道菌群失衡如何引发人类疾病的发生。(生物谷Bioon.com)

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Population-level analysis of gut microbiome variation

Gwen Falony1,2,*, Marie Joossens1,2,3,*, Sara Vieira-Silva1,2,*, Jun Wang1,2,*, Youssef Darzi1,2,3, Karoline Faust1,2,3, Alexander Kurilshikov4,5, Marc Jan Bonder6, Mireia Valles-Colomer1,2, Doris Vandeputte1,2,3, Raul Y. Tito1,2,3, Samuel Chaffron1,2,3, Leen Rymenans1,2,3, Chloë Verspecht1,2, Lise De Sutter1,2,3, Gipsi Lima-Mendez1,2, Kevin D’hoe1,2,3, Karl Jonckheere2,3, Daniel Homola2,3,†, Roberto Garcia2,3, Ettje F. Tigchelaar6,7, Linda Eeckhaudt2,3, Jingyuan Fu6,8, Liesbet Henckaerts1,9, Alexandra Zhernakova6,7, Cisca Wijmenga6, Jeroen Raes1,2,3,‡

Fecal microbiome variation in the average, healthy population has remained under-investigated. Here, we analyzed two independent, extensively phenotyped cohorts: the Belgian Flemish Gut Flora Project (FGFP; discovery cohort; N = 1106) and the Dutch LifeLines-DEEP study (LLDeep; replication; N = 1135). Integration with global data sets (N combined = 3948) revealed a 14-genera core microbiota, but the 664 identified genera still underexplore total gut diversity. Sixty-nine clinical and questionnaire-based covariates were found associated to microbiota compositional variation with a 92% replication rate. Stool consistency showed the largest effect size, whereas medication explained largest total variance and interacted with other covariate-microbiota associations. Early-life events such as birth mode were not reflected in adult microbiota composition. Finally, we found that proposed disease marker genera associated to host covariates, urging inclusion of the latter in study design.

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