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Nat Commun:“垃圾”DNA显神效——治疗乳腺癌

  1. “垃圾”DNA
  2. GNG12-AS1
  3. 乳腺癌
  4. 非编码RNA

来源:生物谷 2016-02-03 18:40

近日,发表在国际杂志Nature Communications上的一项研究报告中,来自巴斯大学和剑桥大学的研究人员通过研究发现,位于基因间的垃圾DNA活在抑制癌症发生上扮演着重要角色;人类基因组中包含有大约3米长的DNA,这其中大约有2%的基因行驶着编码蛋白的作用,2000年人类全基因组测序完成后,科学家们就对那剩余的98%的DNA产生了特别浓厚的兴趣。

图片来源:medicalxpress.com

2016年2月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,发表在国际杂志Nature Communications上的一项研究报告中,来自巴斯大学和剑桥大学的研究人员通过研究发现,位于基因间的垃圾DNA活在抑制癌症发生上扮演着重要角色;人类基因组中包含有大约3米长的DNA,这其中大约有2%的基因行驶着编码蛋白的作用,2000年人类全基因组测序完成后,科学家们就对那剩余的98%的DNA产生了特别浓厚的兴趣。

近些年来研究者发现,许多非编码DNA实际上都可以转录成为非编码的RNA,然而非编码的RNA到底在细胞中有没有功能目前科学界存在不同的看法,其中一部分原因就是目前研究人员很难在不损伤DNA的情况下敲除非编码的RNA,而这会引发一系列的脱靶效应及错误的结果。

文章中,研究人员发现,一系列不编码蛋白的DNA可以转录形成非编码RNA,而这一过程可以阻断细胞癌化;Adele Murrell博士说道,机体中细胞的数量往往根据细胞的复制和替换而达到一种动态平衡的过程,有时候控制细胞生长的开关会卡在“开启”的位置,从而引发癌症。随着肿瘤生长癌细胞就会聚集,癌细胞就会开始脱离原始肿瘤,改变形状并且通过血液转移到机体其它组织中去,这就称之为癌症转移,这个过程需要整个基因网络的调控。

研究者鉴别出了一种名为GNG12-AS1的非编码RNA,其可以抑制生长开关被卡住,同时抑制癌症转移,在乳腺癌患者中非编码RNA定位的特殊基因组区域通常是处于损坏的状态,这种控制一旦被移除就会引发癌细胞扩散。

同时研究者还发现,非编码的RNA片段可以通过两种特殊机制来维持健康细胞,首先通过调节DIRAS3的水平,DIRAS3是一种参与细胞复制的邻家基因;其次非编码RNA还可以通过抑制改变细胞形状促进其转移的特殊基因网络来发挥作用。而研究人员可以通过利用小型干扰RNAs来区分这两种机制从而特异性地阻断非编码RNA的产生,或者在非编码RNA被制造后对其进行降解。

Kat Arney说道,本文研究对于揭示非编码RNA的功能并且开发新型基因疗法来治疗癌症提供了新的线索和希望。相关研究由英国癌症研究中心(Cancer Research UK)提供资助。(生物谷Bioon.com)

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Transcriptional silencing of long noncoding RNA GNG12-AS1 uncouples its transcriptional and product-related functions

Lovorka Stojic, Malwina Niemczyk, Arturo Orjalo, Yoko Ito, Anna Elisabeth Maria Ruijter, Santiago Uribe-Lewis, Nimesh Joseph, Stephen Weston, Suraj Menon, Duncan T. Odom, John Rinn, Fanni Gergely & Adele Murrell

Long noncoding RNAs (lncRNAs) regulate gene expression via their RNA product or through transcriptional interference, yet a strategy to differentiate these two processes is lacking. To address this, we used multiple small interfering RNAs (siRNAs) to silence GNG12-AS1, a nuclear lncRNA transcribed in an antisense orientation to the tumour-suppressor DIRAS3. Here we show that while most siRNAs silence GNG12-AS1 post-transcriptionally, siRNA complementary to exon 1 of GNG12-AS1 suppresses its transcription by recruiting Argonaute 2 and inhibiting RNA polymerase II binding. Transcriptional, but not post-transcriptional, silencing of GNG12-AS1 causes concomitant upregulation of DIRAS3, indicating a function in transcriptional interference. This change in DIRAS3 expression is sufficient to impair cell cycle progression. In addition, the reduction in GNG12-AS1 transcripts alters MET signalling and cell migration, but these are independent of DIRAS3. Thus, differential siRNA targeting of a lncRNA allows dissection of the functions related to the process and products of its transcription.

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