新功能、新界面、新体验,扫描即可下载生物谷APP!
首页 » 组学 » Science:人类蛋白质图谱分析大进展

Science:人类蛋白质图谱分析大进展

来源:生物谷 2015-01-24 13:09

2015年1月24日讯 /生物谷BIOON/-- 最新一期的Science公布了基于人类蛋白质图谱的大分析结果,包括与癌症相关的详细蛋白质图片,血液中蛋白质种类和数量,以及市场上被批准的所有药物所作用的目标蛋白质。

人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas),是由Knut and Alice Wallenberg基金会于2014年11月支持的一个大型跨国研究项目。近期他们又开放了一个以人器官组织为基础的蛋白质图谱数据库。基于1300万个注释的图像,整个数据库涵盖了人体中的所有主要组织和器官的蛋白质分布,也标注了仅表达在特定组织,如脑,心脏或肝脏的蛋白。作为一个开放的数据资源,这个数据库提高了对人类生物学的基本见解,更有望帮助推动新的诊断和药物的开发。

Science的这篇文章里,"基于组织的人类蛋白质组图谱" 结合基因组学,转录组学,蛋白质组学,以及基于抗体的分析,详细分析了大约20,000个蛋白质编码基因。分析结果表明,蛋白编码基因几乎一半都是普遍表达在所有分析的组织。而有大概的15%的蛋白质编码基因大量表达在一个或几个特定的组织或器官,包括众所周知的组织特异性蛋白质,如胰岛素和肌钙蛋白。睾丸是含有最丰富种类蛋白质的器官,其后是大脑和肝脏。分析结果还表明,大约3000种蛋白质是从细胞中分泌释放的,另有5500种蛋白位于细胞膜结构。

这一蛋白质图分析结果为制药行业的提供了重要信息。研究小组的Uhlén表示,他们发现了市场上使用的药品有70%的作用目标是分泌或膜结合蛋白。有趣的是,另外30%被发现是作用其他组织和器官,这可能有助于解释药物的一些副作用,并且对未来药物开发提供一定的参考价值。

该数据库已经免费对外开放,网址是www.proteinatlas.org. (生物谷Bioon.com)

本文系生物谷原创编译整理,欢迎转载!转载请注明来源并附原文链接。谢谢!

DOI: 10.1126/science.1260419

PMC:

PMID:

Tissue-based map of the human proteome

M. Uhlen, L. Fagerberg, B. M. Hallstrom, C. Lindskog, P. Oksvold, A. Mardinoglu, A. Sivertsson, C. Kampf, E. Sjostedt, A. Asplund, I. Olsson, K. Edlund, E. Lundberg, S. Navani, C. A.-K. Szigyarto, J. Odeberg, D. Djureinovic, J. O. Takanen, S. Hober, T. Alm, P.-H. Edqvist, H. Berling, H. Tegel, J. Mulder, J. Rockberg, P. Nilsson, J. M. Schwenk, M. Hamsten, K. von Feilitzen, M. Forsberg, L. Persson, F. Johansson, M. Zwahlen, G. von Heijne, J. Nielsen, F. Ponten.

Abstract

Resolving the molecular details of proteome variation in the different tissues and organs of the human body will greatly increase our knowledge of human biology and disease. Here, we present a map of the human tissue proteome based on an integrated omics approach that involves quantitative transcriptomics at the tissue and organ level, combined with tissue microarray-based immunohistochemistry, to achieve spatial localization of proteins down to the single-cell level. Our tissue-based analysis detected more than 90% of the putative protein-coding genes. We used this approach to explore the human secretome, the membrane proteome, the druggable proteome, the cancer proteome, and the metabolic functions in 32 different tissues and organs. All the data are integrated in an interactive Web-based database that allows exploration of individual proteins, as well as navigation of global expression patterns, in all major tissues and organs in the human body.

 

温馨提示:87%用户都在生物谷APP上阅读,扫描立刻下载! 天天精彩!


相关标签

最新会议 培训班 期刊库