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Chem. Commun:科学突破将有助设计新型抗生素

  1. 抗生素
  2. 耐药

来源:生物谷 2014-10-22 10:53

2014年10月19日讯 /生物谷BIOON/ --研究人员在英国布里斯托尔大学集中细菌的酶的作用,其中分裂抗生素的结构和停止它工作,使得细菌抗药性的酶。 新的研究结果发表在化学通讯Chemical Communications,表明有可能测

2014年10月21日讯 /生物谷BIOON/ --英国布里斯托尔大学研究人员关注于细菌中能分解抗生素结构、停止抗生素发挥作用、使细菌获得抗药性的酶的作用。

新的研究结果发表在Chemical Communications杂志上,新研究表明,测试酶对某些抗生素的响应机制是可能的,这将有助于科学家开发抗性风险低得多的新抗生素。

使用一个诺贝尔奖得主开发的技术:QM/MM(量子力学/分子力学模拟),布里斯托尔研究小组能够在分子水平深入了解beta -内酰胺酶对抗生素的反应。

研究人员特别想了解日益耐药的碳青霉烯类,碳青霉烯类被称为抗生素的“最后一招”,其用于针对许多细菌感染和超级细菌如大肠杆菌感染。由于对碳青霉烯类耐药,一些细菌感染将会无法治愈,导致轻微感染也会变得非常危险,甚至致命。

该QM/MM模拟结果显示,在整个耐药发生过程中最重要的一步就是酶'外排'已经被分解的抗生素。如果上述过程发生很快,酶能够继续分解抗生素,细菌获得抗药性。如果缓慢发生,那么这种酶不能分解更多的抗生素,因此细菌更容易死亡。

这个“外排”的速率取决于外排反应能量势垒的高低,如果反应能量势垒高,外排”缓慢发生,如果反应能量势垒低,“外排”则会更快速地发生​​。

Adrian Mulholland教授说:我们已经证明可以用计算机模拟来确定哪些酶分解并迅速外排碳青霉烯类,以及哪些酶缓慢外排碳青霉烯类抗生素。(生物谷Bioon.com)

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QM/MM Simulations as an Assay for Carbapenemase Activity in Class A β-Lactamases

Ewa I. Chudyk, Michael A. L. Limb, Charlotte Jones, James Spencer, Marc W. van der Kamp and Adrian J.

Carbapenems, ‘last resort’ antibiotics for many bacterial infections, can now be broken down by several class A β-lactamases (i.e. carbapenemases). Here, carbapenemase activity is predicted through QM/MM dynamics simulations of acyl–enzyme deacylation, requiring only the 3D structure of the apo-enzyme. This may assist in anticipating resistance and future antibiotic design.

 

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