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Science:DNA纳米技术新进展

  1. 2维
  2. 3维
  3. DNA纳米结构
  4. 结构

来源:生物通 2013-03-26 12:25

来自美国亚利桑那州立大学的研究人员在一项最新成果中,获得了解决一种关键设计难题的新办法,这将能令研究人员生成各种各样的2维和3维结构,从而推动DNA纳米技术新兴领域的发展。该文章发表在3月22日Science上。

来自美国亚利桑那州立大学的研究人员在一项最新成果中,获得了解决一种关键设计难题的新办法,这将能令研究人员生成各种各样的2维和3维结构,从而推动DNA纳米技术新兴领域的发展。该文章发表在3月22日Science上。

领导这一研究的是亚利桑那州立大学颜颢教授,颜颢早年毕业于山东大学,这位以自己独特的技术成果在学术界打出一片天空的华裔科学家,多年来在Science,Nature杂志上发表了多项重要的成果,备受关注。

DNA的2维及3维结构

DNA不仅仅是生命的密码,它还是制造纳米级构件和设备的通用元件。通过现代生物技术,我们可以制造出很长的DNA分子,上面排列着根据意愿选择的构建模块序列,这为DNA的应用开辟了广阔的新天地,而不仅限于自然界中生物进化的领域。

颜颢的研究小组就利用结构DNA纳米技术(利用了DNA作为遗传信息编码聚合物的优点,通过DNA分子卓越的自组装和识别能力实现精确的纳米构架,就如同纳米机械在工作一样),构建了许多重要的结构,如特洛伊木马结构——用以提高药物输送到癌细胞的效率,导电金纳米线,单分子传感器和可编程的分子机器人。

现在他们又继续在分子水平上探索着这些结构的几何和物理限制。“这一领域的研究人员对于构建线性或者网状的结构,十分感兴趣,”颜颢说,“我们需要研发出新的设计思路,来构建更加复杂的三维结构。”

在最新这项研究中,他们完成了类似线框,分子镊子,剪刀,螺丝,手风扇,甚至是一张蜘蛛网之类的2维和3维结构,十分有趣。

通过一种“自下而上”扭曲技术,研究人员将分子乐高设计的关键点聚焦于一种称为Holliday交叉(Holliday junction,HJ)的DNA结构上。在自然界中,这种十字形,双叠DNA结构就像是遗传机制中的十字路口,两个独立的DNA螺旋能用于交换遗传信息。Holliday交叉带来了地球上各种各样的生物,并确保后代具有来自母亲和父亲DNA信息的独特重组。

在自然界里,Holliday交叉能以约60度角的角度扭曲双叠DNA链,这是交换基因的一个完美角度,但有时对于DNA纳米技术的科学家来说,这并不是好消息,因为这限制了其结构的设计规则。

“原则上,你可以利用这个支架横向连接多个层,”然而,当你需要构建垂直方向结构时,DNA的极性就会导致无法构建多层,“我们需要做的是把这个角度旋转过来,进行力量连接”。

研究人员通过改变每个Holliday交叉之间DNA的长度,使得Holliday交叉中几何形状发生了非常规的重排,令这个交叉更加灵活,并首次能在垂直方向上构建结构。颜教授将其称为烧烤架形状,DNA烧烤架。

“我们惊讶的发现这能奏效!”他说,“一旦能完成这样的工作,那么就很容易进行新的设计了。如果你被传统规则所束缚,就很难走出新的一步,一旦你走出了这一步,形势就变得明确了。”(生物谷Bioon.com)

DNA Gridiron Nanostructures Based on Four-Arm Junctions

Dongran Han, Suchetan Pal, Yang Yang, Shuoxing Jiang, Jeanette Nangreave, Yan Liu, Hao Yan.

Engineering wireframe architectures and scaffolds of increasing complexity is one of the important challenges in nanotechnology. We present a design strategy to create gridiron-like DNA structures. A series of four-arm junctions are used as vertices within a network of double-helical DNA fragments. Deliberate distortion of the junctions from their most relaxed conformations ensures that a scaffold strand can traverse through individual vertices in multiple directions. DNA gridirons were assembled, ranging from two-dimensional arrays with reconfigurability to multilayer and three-dimensional structures and curved objects.

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