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成都生物所完成脱落酸高产菌株全基因组测序

来源:中科院成都生物研究所 2012-03-09 09:38

3月8日,中科院成都生物研究在上海人类基因组研究中心的协作下,该所完成了脱落酸高产菌株灰葡萄孢霉(Botrytis cinerea) TBC-A的全基因组测序及分析工作。

B. cinereaTBC-A是成都生物所经过多年改良筛选及系统研发的、具有自主知识产权的脱落酸高产菌株。研究人员以ROCHE 454 GS FLX (Titanium)和Illumina Solexa高通量测序为基础,对整个真菌基因组进行测序,分别获得了20倍和50倍基因组覆盖率的测序量,由此构建了该基因组序列的精细图。通过对全基因组的生物信息学分析,预测了大约11000个基因,并注释了基因功能及参与的代谢网络。

B. cinereaTBC-A全基因组测序工作的完成,为研究该菌株高产脱落酸的分子机理奠定了基础,大大提高了研究的科学性和效率。后续工作拟通过比较转录组学以及与国际上已测序的同类菌株全基因组比较分析等方法,研究真菌生物合成脱落酸的关键基因及其分子机制。

该项工作的完成标志着成都生物所“真菌发酵生产脱落酸”的研究进入了一个新的发展阶段。(生物谷Bioon.com)

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