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DNAnexus联手Google打造云端DNA数据库

  1. NCBI

来源:腾讯科技 2015-03-26 06:25

DNANexus专注于建立一个云计算服务器中的DNA数据库,然后以服务方式将该数据库提供给研究者和科学家。 谷歌风险基金合作伙伴克里施纳·耶什万特(Krishna Yeshwant)以及TGP公司合伙人吉奥夫·杜伊克(Geoff Duyk)将加入DNANexus的董事会。

DNANexus专注于建立一个云计算服务器中的DNA数据库,然后以服务方式将该数据库提供给研究者和科学家。

谷歌风险基金合作伙伴克里施纳·耶什万特(Krishna Yeshwant)以及TGP公司合伙人吉奥夫·杜伊克(Geoff Duyk)将加入DNANexus的董事会。

DNANexus公司首席执行官安德里斯·桑德奎斯特(Andreas Sundquist)表示,获得来自谷歌投资的最大一个好处是能够使用该公司的计算基础设备,并有20%的时间获得谷歌员工的帮助。他透露,谷歌将与DNANexus共同合作以对外提供DNA信息历史文档。

DNAnexus和谷歌开展技术合作,提供最为全面的DNA数据库,它可通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)下SRA的网站访问到这些DNA数据(2011年2月,NCBI曾宣布由于联邦政府削减经费支持逐步淘汰SRA)。这些数据将合并进入DNANexus的DNA信息历史文档,并储存于谷歌的云计算服务器,研究者现在可以轻松进行访问。这是谷歌的云计算服务器中最大的第三方数据资料。

桑德奎斯特表示,由私营部门处理DNA数据库可能好于联邦政府,主要是因为排定染色体顺序已经不再复杂和昂贵。

他表示:“我们开创这家公司的原因在于,我们开始意识到DNA定序的费用每18个月降低10倍。10年前,对一个人类染色体定序需要30亿美元。现在只要大约4000美元。几年之后,可能只要不到1000美元。”

他同时指出,此类成本降低意味着有可能出现大量被收集的DNA信息,如此大规模的爆发只有谷歌有能力来处理。(生物谷Bioon.com)

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关于SRA

NCBI的SRA(Sequence Read Archive)数据库是高通量测序存储的代表。详细内容参看 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra

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