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Molecular Cell:韩珉教授发现线虫3500个miRNAs靶标

来源:生物谷 2007-12-10 10:51

        美国科罗拉多大学细胞与发育生物学系,霍德华休斯研究所(HIMM),美国Scripps所(The  Scripps  Research  Institute  ,TSRI)的研究人员在对线虫蛋白研究的过程中,识别出了3500多个潜在的miRNAs靶标,补充了目前数量有限的miRNA靶标mRNA,为解决这一科学研究局限性提供了重要的资料(生物通注)。这一研究成果公布在《Molecular  Cell》杂志上。这篇研究成果的通讯作者是美国科罗拉多大学终身教授韩珉博士。现任NIH基金评审委员会成员,吴瑞协会理事。1999年起每年为复旦大学生科院的研究生讲学,现任复旦大学特聘讲座教授。  

        虽然目前针对miRNAs的基因调控作用研究得较多,但是发现的miRNA靶标mRNA数量依然有限,只有少量mRNA得到了实验鉴定。在最新的这项研究中,研究人员利用各种有效实验手段发现了3500多个潜在的miRNAs靶标,这是对目前miRNA靶标的一个重要补充。

        研究人员首先发现GW182家族蛋白AIN-1和AIN-2能调控miRNA靶标的表达,但不影响miRNA的生物发生(biogenesis),免疫共沉(Immunoprecipitation,IP)和质谱分析(mass  spectrometry)表明AIN-1和AIN-2这两种蛋白只与miRNA特异性Argonaute蛋白:ALG-1和ALG-2,以及核心翻译起始复合物元件相互作用。研究发现在AIN-2复合物中存在许多miRNA靶标,这些miRNA靶标与相应的miRNAs表达相关。

        进一步研究人员利用pyrosequence方法(焦磷酸测序法)联合IP,以及AIN-1/AIN-2相关RNAs芯片分析,从中识别出了106个之前已注释的miNRAs,以及9个新的候选miRNAs,但是几乎没有siRNAs,重要的是,研究人员还发现了3500多个潜在的miRNAs靶标,这几乎包含了目前所有已知晓的靶标。

        这一研究成果提出了一种系统识别miRNA靶标的有效生化方法,并且也为了解miRNA效应器复合物(miRNA  effector  complexes)的特征提供了重要的资料。

有关微RNA:
    微RNA(microRNA,简称miRNA)是生物体内源长度约为20-23个核苷酸的非编码小RNA,通过与靶mRNA的互补配对而在转录后水平上对基因的表达进行负调控,导致mRNA的降解或翻译抑制。对于miRNAs的研究起始于时序调控小RNA(stRNAs),由于miRNAs在物种进化中相当保守,在植物、动物和真菌中发现的miRNAs只在特定的组织和发育阶段表达,而且这种特异性和时序性,决定了组织和细胞的功能特异性,表明miRNA在细胞生长和发育过程的调节过程中起多种作用,因此miRNA的研究受到了生物学家的广泛关注。

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