疫情研究：SARS-CoV-2感染和恢复患者中人口咽微生物组的表征
来源：本站原创 2021-09-03 10:17
呼吸道微生物组与呼吸道感染密切相关，但未对2019冠状病毒病(COVID-19)康复患者的口咽微生物组特征进行研究。
呼吸道微生物组与呼吸道感染密切相关，但未对2019冠状病毒病(COVID-19)康复患者的口咽微生物组特征进行研究。本研究收集COVID-19确诊病例(CCs)(73例)、疑似病例(SCs)(36例)、康复确诊病例(21例)、康复疑似病例(36例)和健康对照(Hs)(140例)的口咽拭子，完成MiSeq测序。口咽微生物휶多样性显著降低CCs和海关。与Hs相比，CCs中条件致病菌数量增加，丁酸产菌数量减少。本研究首次对新冠肺炎恢复期和疑似病例的口咽微生物区系特征进行了研究，成功构建并验证了新冠肺炎的诊断模型，刻画了口咽部微生物区系与临床指标的关系。
图片来源：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34423593/
2019年冠状病毒病(新冠肺炎)是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)引起的呼吸道传染病。截至2021年8月12日，COVID-19已在全球蔓延，造成2亿多人死亡，400多万人死亡，这一数字仍在迅速增长。因此，快速、早期发现潜在感染者，特别是无症状感染者，是缩小传播范围的重点。目前，通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对上呼吸道标本进行核酸检测是诊断COVID-19的金标准。然而，由于病毒突变、采样错误、病毒滴度低等各种原因，RT-PCR的假阴性率至少为20%。因此，寻求一种更准确的诊断方法势在必行。
呼吸道作为抵御病原体入侵的第一道屏障，也是病原体复制和移动的场所。SARS-CoV-2可在人上呼吸道标本中检测到，包括鼻咽和口咽标本，并通过呼吸道飞沫传播。病毒通过将其刺突蛋白与人细胞上的血管紧张素转换酶2 (ACE2)结合进入宿主细胞。TMPRSS2有助于激活SARS-CoV-2上的刺突蛋白。病毒进入宿主细胞后，不仅会引起炎症和免疫紊乱，还会破坏上呼吸道微生物平衡。
人体呼吸道微生物群与呼吸道感染密切相关，是上呼吸道屏障的重要组成部分。在病毒感染期间，气道微生物群的破坏可能会影响宿主的固有免疫反应。同时，病毒的定植和增殖也受到呼吸道微生物群的影响。Man等人发现，口腔和鼻咽部微生物区系之间的微生物地形图缺失促进婴幼儿呼吸道感染。进一步的研究报告称，接触时的鼻/喉微生物群与流感感染的易感性有关。目前的一些研究已经描述了SARS-CoV-2感染中的鼻咽部和口咽部微生物群，提示了呼吸道微生物群在COVID-19发展中的功能。然而，SARS-CoV-2感染恢复期患者的口咽部微生物群尚未见报道。
口咽微生物与SARS-CoV-2感染患者康复的关系
图片来源：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34423593/
使用微生物标志物作为非侵入性诊断工具的概念已经逐渐形成，包括肝硬化和2型糖尿病(T2D)。作者的研究之前曾报道，口腔和肠道微生物标志物可能成为COVID-19的一种潜在的无创诊断工具，实现跨区域验证，并成功诊断免疫球蛋白G (IgG)阳性的疑似病例(SCs)为确诊病例。然而，应用口咽部微生物标志物在SARS-CoV-2感染中的诊断潜力尚未得到评估。在这项研究中，作者描述了SARS-CoV-2感染中的上呼吸道微生物群，并构建了非侵入性微生物诊断模型。（生物谷 Bioon.com）
参考文献
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