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云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功

  从20世纪70年代开始,云南省怒江州就开始种植草果,到2020年,种植面积已达111万亩,不仅是全国草果的核心产区,也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。为了加快提高草果遗传改良效率,培育高产、抗病、优质、安全新品种,对从源头创新保障草果产业健康可持续发展,2019年9月,怒江州联合华南农业大学等国内外高校科研院所机构,正式启动草果全基

2021-01-15

科学家利用纳米孔测序同时获取染色质可及性和甲基化信息

 近年来随着DNA测序技术的蓬勃发展,蛋白质结合位点的高通量鉴定、染色质可及性及甲基化状态分析等检测技术不断涌现,其中很多技术(如DNase-seq和ATAC-seq等)依赖于开放性染色质对转座酶等的敏感性。在这些新技术中,全基因组核小体定位及DNA甲基化组测序技术(NOMe-seq)能够利用外源性M. CviPI GpC甲基转移酶标记基因组可及性

2021-01-06

12月1日世界艾滋病日 重磅级研究成果聚焦HIV研究领域新进展!

2020年12月1是第33个世界艾滋病日,今年世界艾滋病日的主题是“携手防疫抗艾、共担健康责任“,本文中,小编整理了多篇重磅级研究成果,共同聚焦科学家们在HIV研究领域取得的新进展,分享给大家!【1】Sci Adv:关键分子IP6对于HIV病毒衣壳的形成过程至关重要doi:10.1126/sciadv.abc6465近日,一项刊登在国际杂志Science A

2020-12-01

研究完成海湾扇贝两个亚种的基因组测序和组装

 日前,青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展,海洋科学与工程学院王春德教授课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组的测序和分析,相关研究成果在线发表在Nature旗下开源期刊Scientific Data上。此前,王春德课题组已完成紫扇贝基因组的测序和组装,紫扇贝和海湾扇贝两个亚种基因组的成功测序,为从分子水平解析海湾扇贝

2020-11-20

纳米孔全长cDNA测序和直接DNA甲基化分析解决大麻基因组拷贝数的争论

 大麻(Cannabis sativa)通常分为大麻(Marijuana)和工业大麻(Hemp),通常依据植物产生THC(四氢大麻酚)的含量来区分:大麻的THC含量通常较高(> 10%),工业大麻通常较低(<0.3%),但他们都可以产生高水平的CBD(大麻二酚),工业大麻可用作纤维和燃料且市场增长很快。2015年,索尔克生物研究所(Sa

2020-11-19

香港理工大学副教授Gilman Kit Hang Siu 研究团队:纳米孔测序分析香港第三波疫情或由外地输入

 7月初起,中国香港特区出现第三波新冠病毒大规模传播。7月底,香港文汇报、轻新闻、icable TV、now TV等多家媒体报道:香港理工大学副教授Gilman Kit Hang Siu(萧杰恒)研究团队基于纳米孔测序技术,对26名病人病毒样本进行SARS-CoV-2溯源研究,发现确诊感染者体内的病毒株属同类(“G型病毒株”的变种“GR型病毒株”)

2020-11-17

香港大学Kelvin Kai-Wang To 博士团队:纳米孔全基因组测序分析发现全球首例COVID-19康复患者二次感染

 8月,香港大学Kelvin Kai-Wang To 博士团队利用纳米孔手持便携式测序仪MinION进行全基因组测序,结合ARTIC和Medaka工作流程分析,发现全球首例COVID-19康复者二次感染病例,基因组学分析显示两次感染病毒不同。对两次感染的病毒基因组学进行分析发现首次感染的病毒基因组属于GISAID V分支、Nextstain19A分

2020-11-17

PLoS Med:女性孕期的饮食和生活方式或与后代机体DNA的表观遗传学修饰改变直接相关

2020年11月16日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志PLoS Medicine上的研究报告中,来自南安普敦大学等机构的科学家们通过研究发现,肥胖的孕妇或能通过改善饮食和更多的体育锻炼来帮助降低其后代所面临的健康风险;相关研究调查了高糖对妊娠糖尿病女性的影响以及对婴儿机体DNA的改变。如今妊娠糖尿病在全球女性中越来越普遍,而且人群的肥

2020-11-16

EMBO J:科学家在大脑中发现了一种能有效清除有害细胞碎片的“候补”机制

2020年11月16日 讯 /生物谷BIOON/ --大脑中特殊的免疫细胞—小胶质细胞或在移除大脑中细胞碎片过程中扮演着主要的角色,近日,一项刊登在国际杂志The EMBO Journal上的研究报告中,来自日本名古屋大学等机构的科学家们通过研究发现,另外一种名为星形胶质细胞的大脑细胞或许也参与到了清理大脑细胞碎片的过程中,而其这一行为被认为是小胶质细胞的后

2020-11-16

利用纳米孔全基因组测序追溯陆丰新冠病毒来源

 8月14日,广东省汕尾陆丰市报告发生一起新冠肺炎疫情,通过基因同源性比对确定不同病毒株间的亲缘关系和传播过程,能够为公共卫生防控措施提供有力证据和信息,对疫情防控意义重大。广东省疾控中心微检所所长武婕牵头的团队第一时间采取5例感染个案的鼻咽拭子样本,使用纳米孔便携式一体化设备MinION Mk1C,结合ARTIC工作流程,及时完成了COVID-1

2020-11-15