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Frontiers in Plant Science:大豆突变体基因定位测序方法改良研究获进展

随着新一代测序技术的发展和全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)成本的不断下降,基于WGS的分离群体分组分析(Bulk Segregation Analysis,BSA)已成为快速定位候选基因的常规工具,但已报道的方法仍有待完善。例如,依赖于自交系杂交的QTL-seq策略需要后期耗费大量精力进行精细定位;而基于突变体的Mut

2021-06-07

Cell:中国科研人员揭示水稻基因组中的“隐藏”变异

  我国科研人员采用第三代基因测序技术,揭示了水稻基因组中的“隐藏”变异。这一研究成果《基于33个水稻遗传多样性材料的泛基因组分析揭示“隐藏”的基因组变异》,近日在国际学术期刊《细胞》在线发表。据介绍,四川农业大学水稻研究所李仕贵、钦鹏团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志团队选取了具有高度代表性的33个水稻材料,采用最新的第三代基

2021-06-02

红豆杉染色体水平基因组测序完成

  紫杉醇是目前已发现的最优秀的天然抗癌药物。紫杉醇生物合成途径已研究多年,而超大的基因组和复杂的代谢路线是途径解析的主要限制因素。中国科学院天津工业生物技术研究所与西北工业大学、深圳华大生命科学研究院等合作,首次完成了喜马拉雅红豆杉超10Gb的染色体水平的全基因组测序,并通过复杂基因组组装与分析,解析了红豆杉中生物合成紫杉醇的关键基因簇

2021-06-01

研究揭示青藏高原长期变暖对丛枝菌根真菌群落的影响取决于生境类型

丛枝菌根真菌(AMF)是广泛存在的与根相关的微生物,参与一些生态系统过程。然而,学界关于AMF群落对全球变暖的反应仍知之甚少,特别是在高海拔地区。针对上述问题,中国科学院西北高原生物研究所青海省寒区恢复生态学重点实验室和天水师范学院、兰州大学等单位合作,研究了青藏高原高寒草甸生态系统中灌丛和草甸两种生境类型的AMF群落对17年开顶室增温棚(OTC)的响应。为

2021-05-23

热度攀升,肿瘤NGS检测或将进入新的快车道

5月14日,由Illumina(因美纳)举办的首届NGS行业盛会圆满落幕,此次大会汇聚NGS产业、健康领域和资本行业各方领军人士,聚焦肿瘤与微生物感染领域,共同回顾近年来产业发展之路,梳理当下问题,展望未来方向。

2021-05-17

鹦鹉螺基因组测序分析揭示针孔眼形成和生物矿化机制

  近日,中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室喻子牛团队首次在国际上完成了鹦鹉螺全基因组测序,揭示了这种古老软体动物的进化规律、针孔眼形成和生物矿化机制。相关研究成果以论文“The genome of Nautilus pompilius illuminates eye evolution and biomineral

2021-05-11

因美纳向全球病原体基因组计划捐赠6000万美元测序设备

2021年4月28日,因美纳(纳斯达克股票代码:ILMN)携手比尔及梅琳达·盖茨基金会及其他公共和私营机构,承诺为全球病原体基因组计划捐赠价值6,000万美元的测序设备。该计划是2020年10月宣布的非洲病原体基因组计划(Africa PGI)的扩展,将有助于在全球范围内构建一个全面的病原体基因组网络,在需要帮助的地区构建关键的公共卫生管理能力。

2021-05-07

全球本地化战略成效显著,诺禾致源跻身世界基因测序产业前列

进入二十一世纪以来,经济全球化发展突飞猛进,越来越多的国内企业开启了“走出去”战略,置身于激烈的世界市场竞争潮流中,不断提升企业竞争力。聚焦基因测序行业,随着高通量测序(NGS)技术的飞速发展,中国基因测序市场开启了加速追赶的步伐,成为全球增速最快的国家。与此同时,国内企业通过紧密追踪国际前沿技术,加快脚步迎头赶上。诺禾致源作为一家面向全球的基因测序服务企业

2021-05-06

多年生禾本科芒属南荻基因组序列草图绘制完成

中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员韩斌课题组与中科院植物研究所北方资源植物重点实验室及系统与进化植物学国家重点实验室研究员桑涛课题组长期合作,完成了多年生禾本科芒属南荻基因组序列草图的绘制。相关研究成果以Chromosome-scale assembly and analysis of biomass crop Miscanthus lutariori

2021-05-05

Nature:科学家开发出了一种新型模型 或能绘制出与疾病基因相关的风险突变的多种图谱

2021年4月13日 讯 /生物谷BIOON/ --如今,全基因组关联性研究(GWAS)已经确定了数千种与多种人类疾病发生相关的遗传突变,但这些研究往往并不能确定基因突变到底会带来哪种特定的特征或疾病;近日,一篇发表在国际杂志Nature上题为“Genome-wide enhancer maps link risk variants to disease g

2021-04-13