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西湖大学马丽佳团队开发全新深度学习模型,精准预测SpCas9/gRNA活性及特异性

在多个GUIDE-seq测试数据集上相对于应用较广的CFD模型,AIdit_OFF无论特异性还是召回率表现的都更好,且将预测gRNA脱靶位点的精准率平均提高了2.6倍。

2023-05-25

科研人员构建全球虫媒病毒与节肢动物特异性病毒综合信息数据集

吸血节肢动物中传播循环的病毒有两大类,即虫媒病毒(arbovirus)和节肢动物特异性病毒(arthropod-specific virus,ASV)。虫媒病毒能在脊椎动物和节肢动物中复制

2023-05-25

对化学家来说,AI革命尚未发生

AI大佬Geoffrey Hinton近期辞去了谷歌职务,离职原因十分明确:畅所欲言地谈论AI的风险。

2023-05-23

研究发现MAGI家族蛋白的PDZ-GK超结构域是一种新型磷酸化蛋白识别模块

蛋白质的磷酸化/去磷酸化及其介导的蛋白复合物的组装/解离是细胞内信号转导的关键调控方式之一。磷酸化依赖的蛋白-蛋白相互作用通常是由磷酸化蛋白结合结构域介导。这些结构域包括14-3-3、FHA、MH2、

2023-05-18

《科学》:蛋白设计技术革命!生化大牛David Baker团队颠覆蛋白设计方法,通过强化学习逆向从头创造全新蛋白

以类似的思路,MCTS具有产生任何我们指定的几何形状的蛋白的能力。我小小声预言一句,蛋白学的未来,翻天覆地了!

2023-04-25

研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics

近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组研究所(国家生物信息中心)章张、宋述慧团队,开发了大豆多维组学深度整合数据库SoyOmics。

2023-04-10

AlphaFold开发者再获大奖,“诺奖风向标”盖尔德纳奖首次颁给非生物医学领域

2016年,分子生物学家、美国艺术与科学院院士、美国国家科学院院士、美国国家发明家科学院院士、美国国家医学院院士、麻省理工学院教授张锋因对CRISPR基因编辑技术的贡献获得盖尔德纳奖。

2023-04-04

Nature子刊:腾讯AI Lab提出蛋白质相互作用研究AI模型

该研究将深度学习领域的层次图学习技术引入蛋白质相互作用(PPI)研究,提出了一种双视图层次图学习模型(HIGH-PPI),模型被证明在 PPI 的研究中具有更高的预测准确性和更好的可解释性。

2023-04-04

科研人员发展了蛋白质关键别构残基预测方法

别构调控在酶催化、信号传导等多种生物学过程中发挥着重要作用。与传统的作用于生物功能位点的正构药物相比,别构药物由于具有更高的特异性、更少的副作用以及能有效克服已有的耐药性突变等独特优势而受到广泛关注。

2023-03-20

Nature子刊:膜孔通道膜蛋白Panx2的三维精细结构和激活机理获得进展

ATP膜孔通道膜蛋白在人体和细胞生理过程中发挥着重要的生理功能,包括免疫调节、能量产生和癌症等。

2023-03-15