Nature：新型人工智能系统或能改善多种人类复杂转移性癌症的诊断
2021年5月7日 讯 /生物谷BIOON/ --原发不明癌症（CUP，Cancer of unknown primary）是一组非常神秘的癌症诊断形式，即肿瘤起源的主要原发性位点并不能被确定，这对于科学家们而言是一项巨大的挑战，因为现代的治疗方法主要针对原发性肿瘤；最近的研究集中在使用基因组学和转录组学来识别肿瘤的起源；然而基因组的检测并不总是能奏效，而且
蛋白质组学研究领域取得新进展
近年来，蛋白质相关数据海量增加，极大地促进了蛋白质组学的发展，高通量蛋白质组学数据挖掘研究已成为国内外生物信息学研究的热点和学科前沿。蛋白质的功能、代谢以及信号传导等生物过程都与其亚细胞定位密切相关，新合成的蛋白质必须处于合适的亚细胞位置才能正常行使其功能。而异常的蛋白质亚细胞位置能够影响蛋白质的功能，并与人类疾病息息相关，如阿尔兹海
PNAS:“实时”转录组学揭示果蝇接种肿瘤细胞后的免疫防御机制
此前研究发现，通过将致癌的RasV12细胞注射到成年雄性果蝇中，会在经过几天的滞后期后大量繁殖，并导致2至3周后果蝇死亡。针对这一现象，来自法国斯特拉斯堡大学的Jules A. Hoffmann团队等人对细胞注射期间的转录组特征进行了研究。相关结果发表在最近的《PNAS》杂志上。
PNAS: CD4受体多样性展现灵长类物种抵抗免疫缺陷病毒的保护机制
人和猿猴免疫缺陷病毒（HIV / SIV）对宿主的感染依赖于病毒包膜糖蛋白（Env）与免疫细胞表面的宿主蛋白CD4结合。尽管在人类中该结构域相对稳定，但黑猩猩CD4的Env结合域则存在高度多态性：在野生种群中有9个不同的变体。在最近发表在《PNAS》杂志上的一项研究中，来自宾夕法尼亚大学的Beatrice H. Hahn团队发现： CD4多样性并非黑猩猩独有
Cancer Cell: 晚期肾癌患者接受免疫治疗期间的肿瘤和免疫重编程特征
对于晚期肾细胞癌（RCC）患者而言，免疫检查点阻断疗法仅能够对部分患者起到控制病情的作用，然而剩余患者产生耐受性的内在机制目前并不清楚。在近日发表于《Cancer Cell》杂志上的一项研究中，来自Dana-Farber癌症研究所的Eliezer M. Van Allen教授等人对恶性RCC患者接受免疫检查点阻断治疗前后的癌细胞以及免疫细胞进行了单细胞水平的
Nat Microbio: 念珠菌感染引发阴道上皮细胞保护性免疫反应以及组织修复的作用机制
阴道念珠菌病（Vaginal candidiasis）是一种极为常见的传染性疾病，主要由以下4中病原体引起：白色念珠菌（Candida albicans）；光滑念珠菌（Candida glabrata），副念珠菌（Candida parapsilosis）；和热带假丝酵母（Candida tropicalis）。在最近一项发表在《Nature Microbi
eLife：科学家开发出新方法来识别癌症发生过程中的突变标签
2021年4月2日 讯 /生物谷BIOON/ --确定癌症突变的原因是当代癌症研究领域科学家们所面临的基本挑战之一，不同的突变过程会诱导不同类型的DNA突变，从而就会提供相应的突变特征来帮助解析癌症的病因，在评估基因组数据时研究人员最广泛使用的特征就是基于未监督的模式，随后才能追溯到与癌症的某些特征相关。日前，一篇发表在国际杂志eLife上的研究报告中，来自
Cell: 研究揭示SARS-CoV-2英国突变株B.1.1.7在美国境内的起源与传播规律
自COVID-19疫情发生至今，已经有多种新型的变异毒株被发现，它们表现出比原始毒株更强的传播力度。其中，一种名为 “501 Y. V1; B.1.1.7” 的毒株携带N501Y突变，该毒株最早于2020年秋季在英国境内出现，之后传播至多个欧洲国家。无独有偶，南非以及巴西境内也鉴定出带有N501Y突变的变异毒株，分别为 “501Y.V2; B.1.351”
Cell Rep：肝脏调节性T细胞如何抑制中性粒细胞介导的自体免疫反应？
此前研究表明，中性粒细胞通过氧化过程，蛋白酶诱导的组织细胞损伤和/或淋巴细胞募集，在各种组织损伤模型（包括慢性炎性疾病）中诱导组织损伤。然而，中性粒细胞也可能具有组织重塑或抗炎特性。Channakeshava Sokke Umeshappa Patricia Solé 6 Bas G.J. Surewaard 6
Cell Rep: 新冠病毒家族ORF6蛋白抑制抗病毒干扰素信号活性
ORF6基因是sarbecoviruses病毒家族（例如SARS-CoV和SARS-CoV-2）与其他beta属冠状病毒最重要的区别。根据最近发表在《Cell Reports》杂志上的一项研究，来自日本东京大学的Kei Sato教授及其同事揭示了ORF6编码蛋白抑制先天免疫信号的活性，例如能够抑制病毒感染后I型与 III型IFN信号的上调。此外，研究发现SA